RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 PKDREJQ9NTG1 2253 aa22.19■■□□□ 1.14
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HOXD8-201ENST00000313173 RAMP3O60896 148 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 CLDN14O95500 239 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 AANATQ16613 207 aa22.19■■□□□ 1.14
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HOXD8-201ENST00000313173 TMEM204Q9BSN7 226 aa22.19■■□□□ 1.14
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HOXD8-201ENST00000313173 LINC00574Q9H8X3 128 aa22.19■■□□□ 1.14
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HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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HOXD8-201ENST00000313173 C17orf98A8MV24 154 aa22.18■■□□□ 1.14
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HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A31Q9H0C2 315 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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HOXD8-201ENST00000313173 CHST1O43916 411 aa22.16■■□□□ 1.14
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HOXD8-201ENST00000313173 ARV1Q9H2C2 271 aa22.14■■□□□ 1.14
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HOXD8-201ENST00000313173 UTF1Q5T230 341 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-201ENST00000313173 NCR3LG1Q68D85 454 aa22.12■■□□□ 1.13
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HOXD8-201ENST00000313173 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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HOXD8-201ENST00000313173 FAM90A26D6RGX4 464 aa22.12■■□□□ 1.13
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HOXD8-201ENST00000313173 FCN3O75636 299 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-201ENST00000313173 KRASP01116 189 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00205P59089 165 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-201ENST00000313173 BAXQ07812 192 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-201ENST00000313173 CT45A1Q5HYN5 189 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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