RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 SCO1O75880 301 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 F2RL1P55085 397 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 UBTD1Q9HAC8 227 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 SPEF1Q9Y4P9 236 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 CAV2P51636 162 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF266Q14584 549 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAT1Q6PIZ9 186 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 BTNL8Q6UX41 500 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 IGFBPL1Q8WX77 278 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 ERGIC1Q969X5 290 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP21.27■■□□□ 1
CAPNS1-204ENST00000587718 GRPP07492 148 aa21.27■□□□□ 0.99
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CAPNS1-204ENST00000587718 CFHR2P36980 270 aa21.27■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 PXDC1Q5TGL8 231 aa21.27■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 ACP7Q6ZNF0 438 aa21.27■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM219AQ8IW50 185 aa21.27■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAM20O43506 726 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 PITX3O75364 302 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 SERPINE2P07093 398 aa21.26■□□□□ 0.99
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM204Q9BSN7 226 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 OOEPA6NGQ2 149 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 H0YL77 283 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 MED6O75586 246 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 VAMP2P63027 116 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 SMR3AQ99954 134 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 ATG12O94817 140 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 APOC3P02656 99 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 DANCRP0C864 163 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 SWI5Q1ZZU3 235 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR82Q6UXN9 313 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 CCL19Q99731 98 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM77I1YAP6 450 aa21.23■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 PLAUP00749 431 aa21.23■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 Q5PR19 223 aa21.23■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS57Q6UWY2 283 aa21.23■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 SVBPQ8N300 66 aa21.23■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 S100PBPQ96BU1 408 aa21.23■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 SEC11CQ9BY50 192 aa21.23■□□□□ 0.99
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR1A1Q9P1Q5 309 aa21.23■□□□□ 0.99
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CAPNS1-204ENST00000587718 IL1F10Q8WWZ1 152 aa21.22■□□□□ 0.99
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CAPNS1-204ENST00000587718 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 WFDC1Q9HC57 220 aa21.22■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 IGLV2-14P01704 120 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV3-13P01766 116 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM252Q8N6L7 170 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 SMIM3Q9BZL3 60 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-204ENST00000587718 UMAD1C9J7I0 102 aa21.2■□□□□ 0.98
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CAPNS1-204ENST00000587718 ABCD4O14678 606 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXO24O75426 580 aa21.2■□□□□ 0.98
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CAPNS1-204ENST00000587718 GLRXP35754 106 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS23P62266 143 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
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CAPNS1-204ENST00000587718 SSX8Q7RTT4 187 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-204ENST00000587718 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa21.2■□□□□ 0.98
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CAPNS1-204ENST00000587718 COA4Q9NYJ1 87 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR14LQ5THK1 2151 aa21.2■□□□□ 0.98
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CAPNS1-204ENST00000587718 FAM90A26D6RGX4 464 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-204ENST00000587718 CD5P06127 495 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-204ENST00000587718 BTN1A1Q13410 526 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF273Q14593 569 aa21.19■□□□□ 0.98
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CAPNS1-204ENST00000587718 MUCL1Q96DR8 90 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF115Q9Y4L5 304 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-204ENST00000587718 ROS1P08922 2347 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-204ENST00000587718 PSPNO60542 156 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-204ENST00000587718 CEACAM6P40199 344 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-204ENST00000587718 FABP6P51161 128 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R30P59541 319 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-204ENST00000587718 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
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