RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 RAB40CQ96S21 281 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 BCL2L14Q9BZR8 327 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 POLEQ07864 2286 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 OR5B21A6NL26 309 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 J3QKU1 62 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 ADAM20O43506 726 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 FABP1P07148 127 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 THBDP07204 575 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 SELEP16581 610 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 GNRHRP30968 328 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 MPV17P39210 176 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 ID3Q02535 119 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 MSMPQ1L6U9 139 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 OR13D1Q8NGV5 346 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 MUCL1Q96DR8 90 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 TVP23CQ96ET8 276 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 OR51M1Q9H341 326 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 OR51I2Q9H344 312 aa8.1□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 SVILO95425 2214 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 FAM221AA4D161 298 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 IFNA1P01562 189 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 OR8U8P0C7N1 319 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 OR13C7P0DN81 318 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 GLRXP35754 106 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 MDH2P40926 338 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 CD200P41217 278 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF83P51522 516 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 CASP6P55212 293 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 TAS2R30P59541 319 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 UBE2KP61086 200 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 RPS23P62266 143 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 SPATA46Q5T0L3 261 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 HEPN1Q6WQI6 88 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 NEK7Q8TDX7 302 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 DYRK2Q92630 601 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 CYYR1Q96J86 154 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.09□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
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POLR1A-208ENST00000486964 A0A1W2PRV1 198 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 H3BQ15 152 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3-13P01766 116 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 SERPINE2P07093 398 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 BCL3P20749 454 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 CA6P23280 308 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 CD40P25942 277 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 AKR1C3P42330 323 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 FHITP49789 147 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 DYNLT3P51808 116 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 CD81P60033 236 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 GNG3P63215 75 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 HBG1P69891 147 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 HBG2P69892 147 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 HLA-DRB3P79483 266 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF718Q3SXZ3 478 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 IGSF11Q5DX21 431 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 DNLZQ5SXM8 178 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZR03 302 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF573Q86YE8 665 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 GAPTQ8N292 157 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 YPEL4Q96NS1 127 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 PKIBQ9C010 78 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 OR51B6Q9H340 312 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 MTCH1Q9NZJ7 389 aa8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.12
POLR1A-208ENST00000486964 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.08□□□□□ -1.12
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