RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 MDS2Q8NDY4 140 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 DBX1A6NMT0 343 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 H0Y8G0 127 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 PGA5P0DJD9 388 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 GNB2P62879 340 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 FAM166AQ6J272 317 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 IL19Q9UHD0 177 aa6.61□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PPB8 328 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PRS3 328 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 KIR3DP1A8MWS1 328 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 ZNF732B4DXR9 585 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 MPPED1O15442 326 aa6.61□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 B9A039 149 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 J3QKU1 62 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 ZNF253O75346 499 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 CDS2O95674 445 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 PI3P19957 117 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 GPM6AP51674 278 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 EDDM3BP56851 147 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 PAX5Q02548 391 aa6.6□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.6□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 DEPPQ9NTK1 212 aa6.6□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 BRS3P32247 399 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 MPV17LQ2QL34 196 aa6.6□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.6□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 C5orf42Q9H799 3197 aa6.6□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 DAOP14920 347 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OTPQ5XKR4 325 aa6.6□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.6□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.6□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 DIRC3C9JPN6 131 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 SMPD2O60906 423 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 BPIFB3P59826 476 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP54-210ENST00000466048 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 SIGLEC5O15389 551 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 PDE6DO43924 150 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 TUSC2O75896 110 aa6.59□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 LHX2P50458 406 aa6.59□□□□□ -1.35
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