RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434424.5

PTPRK-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-212ENST00000434424 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 TRIM49D1C9J1S8 452 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 FABP7O15540 132 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 SERPINB7O75635 380 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 OR56A5P0C7T3 313 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 PSMB5P28074 263 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 CMPK1P30085 196 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 TAS2R31P59538 309 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 CDK5Q00535 292 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
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PTPRK-212ENST00000434424 OR4K2Q8NGD2 314 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 OR1J4Q8NGS1 313 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 OR6N1Q8NGY5 312 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 COQ8AQ8NI60 647 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 GHSRQ92847 366 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 KCNS1Q96KK3 526 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 FOPNLQ96NB1 174 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF285Q96NJ3 590 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 OR4K3Q96R72 315 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 ARL5AQ9Y689 179 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 AKAP9Q99996 3911 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 PKDREJQ9NTG1 2253 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 IGHV1-8P0DP01 117 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 FAM53BQ14153 422 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 TMED2Q15363 201 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 CEACAM21Q3KPI0 293 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 MPV17L2Q567V2 206 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 CALHM1Q8IU99 346 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 RPRMLQ8N4K4 120 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 OR13G1Q8NGZ3 307 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 OR52P1PQ8NH57 321 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 NAT14Q8WUY8 206 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 RAD51AP1Q96B01 352 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 SNF8Q96H20 258 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 HBEGFQ99075 208 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 RBBP8Q99708 897 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 LRTM1Q9HBL6 345 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 FBXL3Q9UKT7 428 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 RAB22AQ9UL26 194 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 PSG11Q9UQ72 335 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 A0A1B0GVX0 72 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 C11orf94C9JXX5 98 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 H0YGG7 62 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 M0R1X1 148 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 ANGPTL7O43827 346 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 OR4D2P58180 307 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 NDPQ00604 133 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 MPPED2Q15777 294 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 NIPAL1Q6NVV3 410 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 C11orf53Q8IXP5 236 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF426Q9BUY5 554 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 FAM96AQ9H5X1 160 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 HMG20AQ9NP66 347 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 DIABLOQ9NR28 239 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 CSPG4Q6UVK1 2322 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF861PO60384 105 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 CCDC22O60826 627 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 ADAP1O75689 374 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 NSA2O95478 260 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 RAB36O95755 333 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 STATHP02808 62 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 MT-ND4P03905 459 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 LIMS3P0CW19 117 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 LIMS4P0CW20 117 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF19P17023 458 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 ELK1P19419 428 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 OPRM1P35372 400 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 TTPAP49638 278 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 CEACAM16Q2WEN9 425 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 TIMM23BQ5SRD1 257 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 WDFY1Q8IWB7 410 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 DRAM1Q8N682 238 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 CCNYL1Q8N7R7 359 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 LFNGQ8NES3 379 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 LINC01560Q8TB33 94 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 ENKURQ8TC29 256 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 BLNKQ8WV28 456 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 WDR34Q96EX3 536 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRK-212ENST00000434424 RNF157Q96PX1 679 aa4.83□□□□□ -1.64
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