RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 SLC35E4Q6ICL7 350 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 WDR82Q6UXN9 313 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 Q6ZS92 163 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 MUC15Q8N387 334 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 FRZBQ92765 325 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 CORO2AQ92828 525 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 NUP210LQ5VU65 1888 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM56Q96MV1 263 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00052Q96N35 136 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 IL19Q9UHD0 177 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 SVILO95425 2214 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 GUK1Q16774 197 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 SLC25A22Q9H936 323 aa8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 C10orf142B7Z368 130 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 C12orf77C9JDV5 145 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 OR7C2O60412 319 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 DRAM1Q8N682 238 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 HARBI1Q96MB7 349 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 S1PR2O95136 353 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 CT45A6P0DMU7 189 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 CT45A5P0DMU8 189 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 CT45A7P0DMV0 189 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 TIMP3P35625 211 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 SPSB4Q96A44 273 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 COX7A2P2O60397 106 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM65Q6PI78 240 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 RBKSQ9H477 322 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 FAM157AC9JC47 383 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 OR2A4O95047 310 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 NQO2P16083 231 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 SULT1A1P50225 295 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 HTD2P86397 168 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 LURAP1Q96LR2 239 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 OR2A7Q96R45 310 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 HPRT1P00492 218 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 CD200P41217 278 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 RAB13P51153 203 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 UCP3P55916 312 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 NECAP1Q8NC96 275 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 OR10Z1Q8NGY1 313 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 RNF138Q8WVD3 245 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.47□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 FGFRL1Q8N441 504 aa8.46□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 LPAR3Q9UBY5 353 aa8.46□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.46□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 PITX3O75364 302 aa8.46□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.46□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.46□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.46□□□□□ -1.05
TTPAL-202ENST00000372904 RBP4P02753 201 aa8.46□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 OR13D1Q8NGV5 346 aa8.46□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.46□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 B9A039 149 aa8.46□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 ZFP82Q8N141 532 aa8.46□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.46□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 TNFRSF19Q9NS68 423 aa8.46□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 DOK5Q9P104 306 aa8.46□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa8.45□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 YIF1AO95070 293 aa8.45□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.45□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.45□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8.45□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TTPAL-202ENST00000372904 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms