RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368378.7

THBS3-201, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,145 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-201ENST00000368378 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 ZNF320A2RRD8 509 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 OR6C6A6NF89 314 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 WNT9BO14905 357 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 DEGS1O15121 323 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 SPINK4O60575 86 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 HIST1H2BKO60814 126 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 HIST1H2BJP06899 126 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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THBS3-201ENST00000368378 HIST1H2BDP58876 126 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 HIST1H2BCP62807 126 aa7.56□□□□□ -1.2
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THBS3-201ENST00000368378 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.56□□□□□ -1.2
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THBS3-201ENST00000368378 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa7.56□□□□□ -1.2
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THBS3-201ENST00000368378 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.56□□□□□ -1.2
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THBS3-201ENST00000368378 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.56□□□□□ -1.2
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THBS3-201ENST00000368378 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.55□□□□□ -1.2
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THBS3-201ENST00000368378 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 TCFL5Q9UL49 500 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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THBS3-201ENST00000368378 CST2P09228 141 aa7.54□□□□□ -1.2
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THBS3-201ENST00000368378 DDTP30046 118 aa7.54□□□□□ -1.2
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THBS3-201ENST00000368378 ABHD17BQ5VST6 288 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.54□□□□□ -1.2
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THBS3-201ENST00000368378 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.54□□□□□ -1.2
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THBS3-201ENST00000368378 WDR54Q9H977 334 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 TAAR3PQ9P1P4 343 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-201ENST00000368378 ZZEF1O43149 2961 aa7.54□□□□□ -1.2
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