RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BQ15 152 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 SRP19P09132 144 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 B4GALT1P15291 398 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 LOXP28300 417 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TGFBR3Q03167 851 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGYQ3MUY2 71 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35E3Q7Z769 313 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 OR11L1Q8NGX0 322 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2AE1Q8NHA4 323 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 IL22RA2Q969J5 263 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 OPA3Q9H6K4 179 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM38BQ9NVV0 291 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PLCE1Q9P212 2302 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TGOLN2O43493 480 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1D-12P01611 117 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM252Q8N6L7 170 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 IGSF23A1L1A6 192 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM24AA6NFZ4 105 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 DNLZQ5SXM8 178 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TVP23CQ96ET8 276 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 RARRES2Q99969 163 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 HSD17B6O14756 317 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PLAUP00749 431 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PATE4P0C8F1 98 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 S100A2P29034 98 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS10P46783 165 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2KP61086 200 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 FGFBP3Q8TAT2 258 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PLPPR2Q96GM1 343 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXB1Q99853 325 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 GGACTQ9BVM4 153 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF442Q9H7R0 627 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CTXN2P0C2S0 81 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF83P51522 516 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CD81P60033 236 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 KHDC3LQ587J8 217 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF774Q6NX45 483 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB39BQ96DA2 213 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 DPRXA6NFQ7 191 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 TK1P04183 234 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 VDAC1P21796 283 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ID3Q02535 119 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR37O15354 613 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 GNRHRP30968 328 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 IL24Q13007 206 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF429Q86V71 674 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 DFFBO76075 338 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-HP01893 362 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D26Q86UD7 250 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SAXO1Q8IYX7 474 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF581Q9P0T4 197 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 MAST4O15021 2626 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC168Q8NDH2 2452 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 UCP1P25874 307 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 BSPH1Q075Z2 132 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 PLCXD3Q63HM9 321 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf78Q8N4C9 275 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5C1Q8NGR4 320 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 DYRK2Q92630 601 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SPSB4Q96A44 273 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 TREM2Q9NZC2 230 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC14L6B5MCN3 397 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A6P12236 298 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ICAM4Q14773 271 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ELOBQ15370 118 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 EDARADDQ8WWZ3 215 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM242Q9NWH2 141 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 WSB1Q9Y6I7 421 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CELA3BP08861 270 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF32P17041 273 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR2DS4P43632 304 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 GLIPR1P48060 266 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL20P78556 96 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR2DS1Q14954 304 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 NMSQ5H8A3 153 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5D13Q8NGL4 314 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 NEUROG1Q92886 237 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP5SQ99766 215 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 M0R1B8 84 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SSSCA1O60232 199 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF205O95201 554 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 DLK1P80370 383 aa22.16■■□□□ 1.14
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