RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515854.5

ATP2C1-223, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 4

Gene ATP2C1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC35G3	Q8N808	338 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	OR8U1	Q8NH10	309 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	UBALD1	Q8TB05	177 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	CORO2A	Q92828	525 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARL11	Q969Q4	196 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	C14orf79	Q96F83	325 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	GAFA1	Q96PS6	74 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCL13	Q99616	98 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARL6	Q9H0F7	186 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZFP57	Q9NU63	452 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	MBD2	Q9UBB5	411 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	LAMA5	O15230	3695 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	IGF2R	P11717	2491 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	BSN	Q9UPA5	3926 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854		A0A1B0GW55	424 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	RNF212B	A8MTL3	300 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPIAL4D	F5H284	164 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ITGB1BP1	O14713	200 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	SPINT2	O43291	252 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	TNFSF12	O43508	249 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	BCL2L11	O43521	198 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	YPEL1	O60688	119 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	DEDD	O75618	318 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	RP2	O75695	350 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	CLDN14	O95500	239 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	FSTL3	O95633	263 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	IFNA7	P01567	189 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	GYPA	P02724	150 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	RLN2	P04090	185 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	PET100	P0DJ07	73 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC25A6	P12236	298 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	SELL	P14151	372 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	VDAC1	P21796	283 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	GNLY	P22749	145 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	SSTR5	P35346	364 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPOX	P50336	477 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	EDDM3A	Q14507	147 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	GNMT	Q14749	295 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	MORN2	Q502X0	79 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF585B	Q52M93	769 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	NMS	Q5H8A3	153 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC51B	Q86UW2	128 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF695	Q8IW36	515 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	MUC15	Q8N387	334 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	DRAM1	Q8N682	238 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	OR1S1	Q8NH92	325 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	RFESD	Q8TAC1	157 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	DCUN1D4	Q92564	292 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	NINJ1	Q92982	152 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	AQP10	Q96PS8	301 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	YPEL2	Q96QA6	119 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	GPHA2	Q96T91	129 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	SPIN2A	Q99865	258 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATP2C1-223	ENST00000515854	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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