RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 NMSQ5H8A3 153 aa14.89□□□□□ -0.03
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ACTB-201ENST00000331789 IL22RA2Q969J5 263 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 SDSLQ96GA7 329 aa14.89□□□□□ -0.03
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ACTB-201ENST00000331789 CCL13Q99616 98 aa14.89□□□□□ -0.03
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ACTB-201ENST00000331789 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 COL6A6A6NMZ7 2263 aa14.89□□□□□ -0.03
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ACTB-201ENST00000331789 GPR146Q96CH1 333 aa14.87□□□□□ -0.03
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ACTB-201ENST00000331789 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.86□□□□□ -0.03
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ACTB-201ENST00000331789 C14orf79Q96F83 325 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
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ACTB-201ENST00000331789 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.86□□□□□ -0.03
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ACTB-201ENST00000331789 BTNL3Q6UXE8 466 aa14.86□□□□□ -0.03
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ACTB-201ENST00000331789 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.86□□□□□ -0.03
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ACTB-201ENST00000331789 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa14.85□□□□□ -0.03
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ACTB-201ENST00000331789 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
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ACTB-201ENST00000331789 BAP18Q8IXM2 172 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.85□□□□□ -0.03
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ACTB-201ENST00000331789 SMIM3Q9BZL3 60 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 CGB3P0DN86 165 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 CGB7P0DN87 165 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 TMEM33P57088 247 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 MORN2Q502X0 79 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 PDZD9Q8IXQ8 264 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A32Q9H2D1 315 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 C11orf1Q9H5F2 150 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 CALYQ9NYX4 217 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
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