RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 SCGB1D1O95968 90 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 ESDP10768 282 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 PSG2P11465 335 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 OR3A1P47881 315 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 PCBD1P61457 104 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 PSG4Q00888 419 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 HYAL1Q12794 435 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 ATP6V1FQ16864 119 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 TMEM249Q2WGJ8 235 aa9.58□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa9.58□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 PRDM14Q9GZV8 571 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 RTP5Q14D33 572 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 CHODLQ9H9P2 273 aa9.58□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 TNFSF12O43508 249 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 ZIC3O60481 467 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 TNFSF13O75888 250 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 IGLV2-14P01704 120 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 EDN3P14138 238 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 TNFSF10P50591 281 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 PRSS12P56730 875 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 RAC1P63000 192 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 SLC38A11Q08AI6 406 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 CLDN23Q96B33 292 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 MS4A10Q96PG2 267 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 CLEC1BQ9P126 229 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 CACNA1BQ00975 2339 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 UNC13CQ8NB66 2214 aa9.56□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 PAFAH1B2P68402 229 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 PRSS8Q16651 343 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 ACSM6Q6P461 480 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 OR4F5Q8NH21 305 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 OR10J5Q8NHC4 309 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 OR4F4Q96R69 305 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 DEFB126Q9BYW3 111 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 GPR35Q9HC97 309 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 TMEM9BQ9NQ34 198 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 TMEM106BQ9NUM4 274 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 A0A0J9YW62 118 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 GJE1A6NN92 205 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 DEGS1O15121 323 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 RAC3P60763 192 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 NRN1LQ496H8 165 aa9.56□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 OR10V1Q8NGI7 309 aa9.56□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 SPOCK3Q9BQ16 436 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa9.56□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 HS3ST1O14792 307 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 PDE6DO43924 150 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 SERPINA7P05543 415 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 B4GALT1P15291 398 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 NTF4P34130 210 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 PPP1CBP62140 327 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 VWC2Q2TAL6 325 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 CEACAM21Q3KPI0 293 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 PRAMEF20Q5VT98 475 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 MKXQ8IYA7 352 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.55□□□□□ -0.88
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