RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296695.9

SPINK1-201, Transcript of serine peptidase inhibitor, Kazal type 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPINK1, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK1-201ENST00000296695 GAB2Q9UQC2 676 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 LIPGQ9Y5X9 500 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ATP23Q9Y6H3 246 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 HEATR5AQ86XA9 2040 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 NBEAQ8NFP9 2946 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 LRP4O75096 1905 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 A0A1B0GV50 99 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 C5orf63A6NC05 138 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 C9orf118A6NHY6 69 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SLC22A20A6NK97 555 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 IFITM10A6NMD0 228 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 RNF212BA8MTL3 300 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ZNF727A8MUV8 499 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 C9J4A7 227 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TMEM250H0YL14 139 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 H0YL77 283 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TRAPPC2LH3BP13 241 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 MKRN2OSH3BPM6 223 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 M0R296 226 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TNFSF11O14788 317 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 DEGS1O15121 323 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ZIC3O60481 467 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CST7O76096 145 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 YIF1AO95070 293 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 GCGP01275 180 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 IGKV1D-12P01611 117 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CRYABP02511 175 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TRGC2P03986 189 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 OPN1LWP04000 364 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CXCL1P09341 107 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 JMJD7P0C870 316 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 FGF5P12034 268 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ZNF32P17041 273 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TMEM11P17152 192 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 OMGP23515 440 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 F2RP25116 425 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 DDTP30046 118 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CCKARP32238 428 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 LTBRP36941 435 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 MDH2P40926 338 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CEBPGP53567 150 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CASP6P55212 293 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CARD18P57730 90 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 RAB11AP62491 216 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 RPL11P62913 178 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CCL20P78556 96 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 PSG4Q00888 419 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 HNF4GQ14541 408 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 PCOLCEQ15113 449 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TGIF1Q15583 401 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SSX2Q16385 188 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ATP6V1FQ16864 119 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CEACAM21Q3KPI0 293 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TMEM41BQ5BJD5 291 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TCEAL6Q6IPX3 200 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ZNF774Q6NX45 483 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CLEC9AQ6UXN8 241 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 COLCA1Q6ZS62 124 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SLC25A26Q70HW3 274 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SSX9Q7RTT3 188 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ZNF575Q86XF7 245 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 GAPTQ8N292 157 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SLC25A45Q8N413 288 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 DEFB119Q8N690 84 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ZNF611Q8N823 705 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 OR10A7Q8NGE5 316 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 OR5A2Q8NGI9 324 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 OR11L1Q8NGX0 322 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 IFI44Q8TCB0 444 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TMEM171Q8WVE6 324 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 PIGCQ92535 297 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 RAB24Q969Q5 203 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TMEM45BQ96B21 275 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 OR5B12Q96R08 314 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SSX3Q99909 188 aa3.39□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 PYGO2Q9BRQ0 406 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms