RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53B-201	ENST00000280780	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	OPN4	Q9UHM6	478 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	HMX3	A6NHT5	357 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM17	Q86X19	198 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780		Q8N7P7	452 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	TERB2	Q8NHR7	220 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780		A0A0A6YYJ9	748 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	C17orf98	A8MV24	154 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	DLX1	P56177	255 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	ARPC4	P59998	168 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	EHF	Q9NZC4	300 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	JMJD1C	Q15652	2540 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	F2RL2	O00254	374 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	LOXL3	P58215	753 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	ARF6	P62330	175 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	GNMT	Q14749	295 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	LTC4S	Q16873	150 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM160	Q9NX00	188 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	SPINT2	O43291	252 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FAM53B-201	ENST00000280780	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	FPR2	P25090	351 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	GALM	Q96C23	342 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	SIRPD	Q9H106	197 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF221	Q9UK13	617 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	VSIG4	Q9Y279	399 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	BET1	O15155	118 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	OR5H8	P0DN80	308 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	ECI1	P42126	302 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	OR51J1	Q9H342	316 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780		A0A1W2PPH5	198 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM172BP	A6NC97	362 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780		M0R1W7	72 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	MMP9	P14780	707 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	TSPAN5	P62079	268 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	HTD2	P86397	168 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	PAX8	Q06710	450 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	AKAP14	Q86UN6	197 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	DIRAS3	O95661	229 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	RBP4	P02753	201 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	RLN1	P04808	185 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	CTXN2	P0C2S0	81 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	LEAP2	Q969E1	77 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	BEX2	Q9BXY8	128 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	GPR132	Q9UNW8	380 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	KPTN	Q9Y664	436 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	IGHV3-7	P01780	117 aa		18.23	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	NFYB	P25208	207 aa		18.23	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		18.23	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	TBX15	Q96SF7	602 aa		18.23	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		18.23	■□□□□ 0.51
FAM53B-201	ENST00000280780	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		18.23	■□□□□ 0.51

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