RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 ALPK2Q86TB3 2170 aa11.98□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 ZNF273Q14593 569 aa11.98□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa11.98□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 ROS1P08922 2347 aa11.98□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 C11orf94C9JXX5 98 aa11.98□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 SOCS1O15524 211 aa11.98□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 F12P00748 615 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 P2RY1P47900 373 aa11.98□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 GAMTQ14353 236 aa11.98□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.98□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 ZNF488Q96MN9 340 aa11.98□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 ZNF714Q96N38 554 aa11.98□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 HILPDAQ9Y5L2 63 aa11.98□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 ATP6V1FQ16864 119 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 VAX2Q9UIW0 290 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 CLDN14O95500 239 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 PCP4P48539 62 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 PIGYQ3MUY2 71 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 C10orf111Q8N326 155 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 MUC15Q8N387 334 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 TIMP4Q99727 224 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 MGST3O14880 152 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 MBPP02686 304 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 HOXA6P31267 233 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 PDLIM4P50479 330 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 PAFAH1B2P68402 229 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 COL10A1Q03692 680 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 MGAT2Q10469 447 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 TMEM116Q8NCL8 245 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 OR1K1Q8NGR3 316 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 KCNK15Q9H427 330 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 ZNHIT1O43257 154 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 OR1L6Q8NGR2 347 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 RNF122Q9H9V4 155 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 NAGKQ9UJ70 344 aa11.97□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 OGG1O15527 345 aa11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 ZNF738Q8NE65 137 aa11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 IL19Q9UHD0 177 aa11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 RABAC1Q9UI14 185 aa11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 A0A1W2PPE3 182 aa11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 F5H697 171 aa11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 IFNL4K9M1U5 179 aa11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 SIAH2O43255 324 aa11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 ASAH2BP0C7U1 165 aa11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 SLC35B1P78383 322 aa11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 ZNF79Q15937 498 aa11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 ATG101Q9BSB4 218 aa11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 PARP11Q9NR21 331 aa11.96□□□□□ -0.49
USP22-201ENST00000261497 FAM74A7A6NL05 159 aa11.96□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 NDUFA2O43678 99 aa11.96□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 APELAP0DMC3 54 aa11.96□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 TEX30Q5JUR7 227 aa11.96□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 DIRC3C9JPN6 131 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 SYNGR3O43761 229 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 OR4A47Q6IF82 309 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 OR8I2Q8N0Y5 310 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 RNF2Q99496 336 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 C9orf172C9J069 976 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 HAX1O00165 279 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 OR4C12Q96R67 309 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 SH2D2AQ9NP31 389 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 IFITM10A6NMD0 228 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 MELTFP08582 738 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 SMIM10L1P0DMW3 83 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 GFRA1P56159 465 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 GUCA2BQ16661 112 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 FDX2Q6P4F2 183 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 SMIM10Q96HG1 83 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 HELTA6NFD8 242 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 SNURFLB1AK76 121 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 K7N7A8 449 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 RHBDL1O75783 438 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 G6PCP35575 357 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 ESPL1Q14674 2120 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 Q8WTZ3 238 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 PRNDQ9UKY0 176 aa11.95□□□□□ -0.5
USP22-201ENST00000261497 SYNGR2O43760 224 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms