RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 RSRP1Q9BUV0 290 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 RGS11O94810 467 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 VSIG10L2P0DP72 767 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 LUMP51884 338 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 DHODHQ02127 395 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 RFESDQ8TAC1 157 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 C8orf46Q8TAG6 207 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 UBALD1Q8TB05 177 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF714Q96N38 554 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 BEX2Q9BXY8 128 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 BEX1Q9HBH7 125 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PPH5 198 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 YPEL1O60688 119 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 DSCR9P59020 149 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 BAMBIQ13145 260 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 C4orf46Q504U0 113 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 LY6G6FQ5SQ64 297 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM200BQ69YZ2 307 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10V1Q8NGI7 309 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 EDARADDQ8WWZ3 215 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM168AQ92567 244 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 YPEL2Q96QA6 119 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 PIMREGQ9BSJ6 248 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAPPC2P0DI81 140 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAPPC2BP0DI82 140 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF626Q68DY1 528 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 C11orf88Q6PI97 169 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC2AQ6UVW9 174 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM185AQ8N0U4 392 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51J1Q9H342 316 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 SPG11Q96JI7 2443 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ITGB1BP1O14713 200 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 LOXL3P58215 753 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 GNB2P62879 340 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF273Q14593 569 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCA11PQ4W5N1 156 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52L2PQ8NGH6 319 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB39BQ96DA2 213 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 BPESC1Q9GZL8 116 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC5A7Q9GZV3 580 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 GNG12Q9UBI6 72 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF221Q9UK13 617 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CBX3Q13185 183 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ESCO2Q56NI9 601 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CD276Q5ZPR3 534 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 HEPN1Q6WQI6 88 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 SECTM1Q8WVN6 248 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CAPSLQ8WWF8 208 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 DMRTB1Q96MA1 342 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 AKR1C4P17516 323 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 LYG2Q86SG7 212 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 C10orf105Q8TEF2 133 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 AKR1E2Q96JD6 320 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 SEC22CQ9BRL7 303 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 GFOD1Q9NXC2 390 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 HMX3A6NHT5 357 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR31O00270 319 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A5O76082 557 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV2-5P01817 119 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV1-13P0DP09 117 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 S100GP29377 79 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 GNRHRP30968 328 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 RND3P61587 244 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 MSMO1Q15800 293 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 Q3ZCU0 254 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 MORN2Q502X0 79 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM230Q96A57 120 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC2A9Q9NRM0 540 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 PIGPP57054 158 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 DHRS2Q13268 280 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 CMTM1Q8IZ96 169 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 NRGNQ92686 78 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 RBP4P02753 201 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 PI3P19957 117 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R1AQ13522 171 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 GNMTQ14749 295 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 SGPP2Q8IWX5 399 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB34Q8NCN2 500 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 LY6G5BQ8NDX9 201 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 PERPQ96FX8 193 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 MED28Q9H204 178 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf170A2RU37 121 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-206ENST00000588815 VWC2LB2RUY7 222 aa25.55■■□□□ 1.68
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