RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509657.5

TMA16-206, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, human

TSL 5

Gene TMA16, Length 933 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMA16-206	ENST00000509657	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	OR52W1	Q6IF63	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	MICU2	Q8IYU8	434 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	RCN3	Q96D15	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	REEP6	Q96HR9	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	ZIM3	Q96PE6	472 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	HES4	Q9HCC6	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	ZNF732	B4DXR9	585 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	C11orf94	C9JXX5	98 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	ZP3	P21754	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	OR1E2	P47887	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	PRKX	P51817	358 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	SLC7A2	P52569	658 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	PRRX1	P54821	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	TMEM187	Q14656	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	ABCB9	Q9NP78	766 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	MED31	Q9Y3C7	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	ANP32D	O95626	131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	CD74	P04233	296 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	PSKH1	P11801	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	IFI30	P13284	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	ALDH3A1	P30838	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	RAB7A	P51149	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	PAX9	P55771	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	GNG3	P63215	75 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	SCARB2	Q14108	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	OPCML	Q14982	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	CNPY4	Q8N129	248 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	PIGC	Q92535	297 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657		A0A1W2PPK0	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	IL6	P05231	212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	LBP	P18428	481 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	APOC4	P55056	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	MTCP1	P56278	107 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	SNCB	Q16143	134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	SLC36A3	Q495N2	470 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	ADCK1	Q86TW2	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	OAF	Q86UD1	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	FTMT	Q8N4E7	242 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TMA16-206	ENST00000509657	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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