RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 VPREB1P12018 145 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CTLA4P16410 223 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 HLA-GP17693 338 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 PAX6P26367 422 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 GATA4P43694 442 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 SULT1A2P50226 295 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CNN1P51911 297 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC37A1P57057 533 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM33P57088 247 aa3.39□□□□□ -1.87
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ANKRD28-213ENST00000498524 LY6G6FQ5SQ64 297 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 OTPQ5XKR4 325 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 MRGPRDQ8TDS7 321 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 KLHDC3Q9BQ90 382 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
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ANKRD28-213ENST00000498524 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A1W2PNV4 684 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 A8MZ25 164 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 F5H5K5 113 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 GPR137BO60478 399 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 LYPD3O95274 346 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 H2AFB1P0C5Y9 115 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 ELLP55199 621 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 C1orf100Q5SVJ3 147 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CBLN3Q6UW01 205 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CMTM1Q8IZ96 169 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC38A9Q8NBW4 561 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 OR52N4Q8NGI2 321 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 OR2G3Q8NGZ4 309 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CTHRC1Q96CG8 243 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 BORCS8Q96FH0 119 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 SPACA5Q96QH8 159 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CLCC1Q96S66 551 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 GFI1Q99684 422 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
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ANKRD28-213ENST00000498524 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
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ANKRD28-213ENST00000498524 C2orf16Q68DN1 1984 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.39□□□□□ -1.87
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ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF117Q03924 483 aa3.39□□□□□ -1.87
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ANKRD28-213ENST00000498524 HAGHQ16775 308 aa3.39□□□□□ -1.87
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ANKRD28-213ENST00000498524 C4orf48Q5BLP8 95 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 HOGA1Q86XE5 327 aa3.39□□□□□ -1.87
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ANKRD28-213ENST00000498524 C1orf159Q96HA4 380 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 SMIM10Q96HG1 83 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 SMDT1Q9H4I9 107 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 GPR84Q9NQS5 396 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 MED29Q9NX70 200 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa3.39□□□□□ -1.87
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ANKRD28-213ENST00000498524 IGKV1D-16P01601 117 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 SEC11BP0C7V7 166 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CT45A8P0DMV1 189 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CT45A9P0DMV2 189 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 OR5H8P0DN80 308 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 VSIG8P0DPA2 414 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF83P51522 516 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 HERV-K104P63124 156 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM3AP98173 230 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 AESQ08117 197 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CD226Q15762 336 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CT45A2Q5DJT8 189 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 NPSR1Q6W5P4 371 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC00114Q6XXX2 140 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 OR8B3Q8NGG8 313 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 SMIM12Q96EX1 92 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 OR8B2Q96RD0 313 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa3.39□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 HELZP42694 1942 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF724A8MTY0 619 aa3.38□□□□□ -1.87
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