RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 TSC22D1Q15714 1073 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 MPPED2Q15777 294 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 ZNF718Q3SXZ3 478 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 DMRTC1Q5HYR2 192 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 OR52W1Q6IF63 320 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 C6orf201Q7Z4U5 140 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 RTN4RL2Q86UN3 420 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 NOXA1Q86UR1 476 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 GVQW1Q8N7I0 195 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 NUP37Q8NFH4 326 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 OR4S1Q8NGB4 309 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 OR11H7Q8NGC8 314 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 OR5AP2Q8NGF4 316 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 SLC6A7Q99884 636 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 DHRS9Q9BPW9 319 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 NRIP2Q9BQI9 281 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 SULT4A1Q9BR01 284 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 PPA2Q9H2U2 334 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 ZNF442Q9H7R0 627 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 AK3Q9UIJ7 227 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 ANXA10Q9UJ72 324 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 MGAT4AQ9UM21 535 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 FLVCR2Q9UPI3 526 aa5.47□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa5.46□□□□□ -1.53
CCL20-202ENST00000409189 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 TUBAL3A6NHL2 446 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 A8MV72 311 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 C16orf97H3BN30 126 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 M0R1B8 84 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 SYNGR1O43759 233 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 RGS11O94810 467 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 DIRAS3O95661 229 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 OR4E1P0C645 316 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 ZNF250P15622 560 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 CALCRP30988 508 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 GLRXP35754 106 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 MPV17P39210 176 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 CD200P41217 278 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 GLP1RP43220 463 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 KIR2DS4P43632 304 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 OR3A3P47888 321 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 ASCL1P50553 236 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 ERVK11-1P61568 191 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 PSG7Q13046 419 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 KIR2DS1Q14954 304 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 GRK1Q15835 563 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 C4orf46Q504U0 113 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 TMED4Q7Z7H5 227 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 WDR86Q86TI4 376 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 POC1AQ8NBT0 407 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 OR13G1Q8NGZ3 307 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 TERB2Q8NHR7 220 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 HYLS1Q96M11 299 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 SEC22CQ9BRL7 303 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 HES4Q9HCC6 221 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 TMEM100Q9NV29 134 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 TREM2Q9NZC2 230 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 EHFQ9NZC4 300 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 MTCH1Q9NZJ7 389 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 VSIG4Q9Y279 399 aa5.46□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 A0A0B4J2A0 478 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 OR2AT4A6NND4 320 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 F5H697 171 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 DEGS1O15121 323 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 MLNRO43193 412 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 NAPSAO96009 420 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 IGHV3-13P01766 116 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 PMP2P02689 132 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 CSN2P05814 226 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 CTXN2P0C2S0 81 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 PRKACAP17612 351 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 PTAFRP25105 342 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 CD34P28906 385 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 NPBWR2P48146 333 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 KCNJ3P48549 501 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 ZNF83P51522 516 aa5.45□□□□□ -1.54
CCL20-202ENST00000409189 TSPAN5P62079 268 aa5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms