RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360752.4

RDH16-201, Transcript of retinol dehydrogenase 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RDH16, Length 3,198 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16-201ENST00000360752 FGF5P12034 268 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 DEFA4P12838 97 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 FUT6P51993 359 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 CD81P60033 236 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 ZXDAP98168 799 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 MAJINQ3KP22 176 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 CST9LP1Q5W188 147 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 ZNF787Q6DD87 383 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 Q6ZVH6 145 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 C11orf42Q8N5U0 333 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 FADS6Q8N9I5 356 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 LPAR2Q9HBW0 351 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 FOXJ2Q9P0K8 574 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 EXPH5Q8NEV8 1989 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 SLC22A20A6NK97 555 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 ZNF732B4DXR9 585 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 SYNGR1O43759 233 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 PITX3O75364 302 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 CEACAM1P13688 526 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 CRYGSP22914 178 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 GDF1P27539 372 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 ERVFC1-1P60608 527 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 HLA-DRB3P79483 266 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 TLE4Q04727 773 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 PCOLCEQ15113 449 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 DCAF10Q5QP82 559 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 OR10D3Q8NH80 312 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 KIAA1456Q9P272 454 aa8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RDH16-201ENST00000360752 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 CBY3A6NI87 242 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 VAMP5O95183 116 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 CTSSP25774 331 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 TNFSF10P50591 281 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 TDRG1Q3Y452 100 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 SPINK9Q5DT21 86 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 VHLLQ6RSH7 139 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 KMT5CQ86Y97 462 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 IL22RA2Q969J5 263 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 ANGPTL4Q9BY76 406 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 RPRMQ9NS64 109 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 CACNG5Q9UF02 275 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 P04436 131 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 GNB2P62879 340 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 PRDX4Q13162 271 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 SSPNQ14714 243 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 FUT9Q9Y231 359 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 ICE1Q9Y2F5 2266 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 A0A1W2PPQ1 181 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 C10orf142B7Z368 130 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 TRAPPC2LH3BP13 241 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 TUSC2O75896 110 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 CDS2O95674 445 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 NGFP01138 241 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 RTP5Q14D33 572 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 CADM4Q8NFZ8 388 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 TUBG2Q9NRH3 451 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 USF3Q68DE3 2245 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 CLDN34H7C241 214 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 CD82P27701 267 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 CLDN15P56746 228 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 C3AR1Q16581 482 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 IQCJQ1A5X6 159 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 AARDQ4LEZ3 155 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 SSX7Q7RTT5 188 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 HLA-CQ95604 372 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 TBX15Q96SF7 602 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 DECR2Q9NUI1 292 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 RNF150Q9ULK6 438 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 GTF3C1Q12789 2109 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 CEP250Q9BV73 2442 aa8.32□□□□□ -1.08
RDH16-201ENST00000360752 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms