RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 RAB40CQ96S21 281 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 PITPNC1Q9UKF7 332 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 OR2W1Q9Y3N9 320 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 R4GN57 208 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 FAM90A10PA6NDY2 464 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 FAM90A18PA6NE21 464 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 FAM90A16PA6NEW6 464 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 FAM90A7PA6NKC0 464 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 GJE1A6NN92 205 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 FAM90A22PA8MWA6 464 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 FAM90A12PA8MX19 464 aa21.5■■□□□ 1.03
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SENP3-201ENST00000321337 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 FAM90A15PP0C7V4 464 aa21.5■■□□□ 1.03
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SENP3-201ENST00000321337 FAM90A14PP0C7W9 464 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 FAM90A24PP0C7X0 464 aa21.5■■□□□ 1.03
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SENP3-201ENST00000321337 COLCA1Q6ZS62 124 aa21.5■■□□□ 1.03
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SENP3-201ENST00000321337 OR4C12Q96R67 309 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 PRDM14Q9GZV8 571 aa21.5■■□□□ 1.03
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SENP3-201ENST00000321337 C5orf49A4QMS7 147 aa21.49■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 OPN1MWP04001 364 aa21.49■■□□□ 1.03
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SENP3-201ENST00000321337 OPN1MW3P0DN78 364 aa21.49■■□□□ 1.03
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SENP3-201ENST00000321337 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 MLF1P58340 268 aa21.49■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa21.49■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 TMEM183AQ8IXX5 376 aa21.49■■□□□ 1.03
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SENP3-201ENST00000321337 TECTBQ96PL2 329 aa21.49■■□□□ 1.03
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SENP3-201ENST00000321337 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 LAMP3Q9UQV4 416 aa21.49■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 TRAV24A0A0B4J272 114 aa21.48■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 TRAPPC2LH3BP13 241 aa21.48■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 SLC31A2O15432 143 aa21.48■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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SENP3-201ENST00000321337 ZNF664Q8N3J9 261 aa21.48■■□□□ 1.03
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SENP3-201ENST00000321337 ZNF737O75373 536 aa21.48■■□□□ 1.03
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SENP3-201ENST00000321337 IFNL4K9M1U5 179 aa21.47■■□□□ 1.03
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SENP3-201ENST00000321337 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 AGBL5Q8NDL9 886 aa21.47■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 WDR54Q9H977 334 aa21.47■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa21.47■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 SRD5A2P31213 254 aa21.47■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 DNLZQ5SXM8 178 aa21.47■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 DEPPQ9NTK1 212 aa21.47■■□□□ 1.03
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SENP3-201ENST00000321337 PAX1P15863 534 aa21.46■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 TESK1Q15569 626 aa21.46■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 MRGPRGQ86SM5 289 aa21.46■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 OR5R1Q8NH85 324 aa21.46■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa21.46■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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SENP3-201ENST00000321337 PINLYPA6NC86 204 aa21.46■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 CD300LBA8K4G0 201 aa21.46■■□□□ 1.03
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SENP3-201ENST00000321337 ZNF585BQ52M93 769 aa21.46■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 TMEM41BQ5BJD5 291 aa21.46■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 NCR3LG1Q68D85 454 aa21.46■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 MKXQ8IYA7 352 aa21.46■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 OR1P1Q8NH06 330 aa21.46■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 OR51B6Q9H340 312 aa21.46■■□□□ 1.03
SENP3-201ENST00000321337 SRD5A3Q9H8P0 318 aa21.46■■□□□ 1.03
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SENP3-201ENST00000321337 OR8G2PQ6IF36 304 aa21.45■■□□□ 1.02
SENP3-201ENST00000321337 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SENP3-201ENST00000321337 LHX4Q969G2 390 aa21.45■■□□□ 1.02
SENP3-201ENST00000321337 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SENP3-201ENST00000321337 PRSS50Q9UI38 385 aa21.45■■□□□ 1.02
SENP3-201ENST00000321337 DNPH1O43598 174 aa21.45■■□□□ 1.02
SENP3-201ENST00000321337 IL18BPO95998 194 aa21.45■■□□□ 1.02
SENP3-201ENST00000321337 RPS16P62249 146 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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