RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 ERVH48-1M5A8F1 160 aa5.47□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 MPC2O95563 127 aa5.47□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 HEXAP06865 529 aa5.47□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 TESK1Q15569 626 aa5.47□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM211Q6ICI0 200 aa5.47□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 RASL12Q9NYN1 266 aa5.47□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 RNF7Q9UBF6 113 aa5.47□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 SORL1Q92673 2214 aa5.47□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa5.46□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 PROP1O75360 226 aa5.46□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 SCGNO76038 276 aa5.46□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 NAT1P18440 290 aa5.46□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 CD24P25063 80 aa5.46□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF497Q6ZNH5 498 aa5.46□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.46□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 C5orf30Q96GV9 206 aa5.46□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 TECTBQ96PL2 329 aa5.46□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 PHB2Q99623 299 aa5.46□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 SIGLEC5O15389 551 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 Q8NFD4 153 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 ODAMA1E959 279 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 CD8AP01732 235 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 C1QBP02746 253 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 MYOD1P15172 320 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 Q3ZCU0 254 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 SGPP2Q8IWX5 399 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 SLC35G3Q8N808 338 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC54Q8NEL0 328 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 MITD1Q8WV92 249 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 APELAP0DMC3 54 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 FPR2P25090 351 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 HLA-DRB3P79483 266 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 GGNBP1Q5YKI7 109 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 Q6ZRM9 215 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF546Q86UE3 836 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM106BQ9NUM4 274 aa5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1B0GV50 99 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 PPIHO43447 177 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 IRF2P14316 349 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 DTYMKP23919 212 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 CITED4Q96RK1 184 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.544e-7■■■■■ 30.2
CNIH1-201ENST00000216416 SLC2A8Q9NY64 477 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 C1QL1O75973 258 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 SFT2D2O95562 160 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 IGLV2-14P01704 120 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 C6orf183Q5T699 404 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 FAM185AQ8N0U4 392 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 OR5M8Q8NGP6 311 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 GALMQ96C23 342 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 SUCNR1Q9BXA5 334 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 HES4Q9HCC6 221 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 LINC00473A8K010 186 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM127O75204 238 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 IL5P05113 134 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 CBX5P45973 191 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 DHRS11Q6UWP2 260 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 TCF23Q7RTU1 214 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 DRAM1Q8N682 238 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 MFFQ9GZY8 342 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 SIRT7Q9NRC8 400 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 IL19Q9UHD0 177 aa5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 A0A0B4J2A0 478 aa5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 H3BUI4 141 aa5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 L7N2F9 121 aa5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 MPPED1O15442 326 aa5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 RPL31P62899 125 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 SAXO1Q8IYX7 474 aa5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF525Q8N782 197 aa5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM217Q8N7C4 229 aa5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 MOB3AQ96BX8 217 aa5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 ANAPC10Q9UM13 185 aa5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 PPIAL4EA0A075B759 164 aa5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 OOEPA6NGQ2 149 aa5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM210A6NLX4 147 aa5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 C17orf98A8MV24 154 aa5.44□□□□□ -1.54
CNIH1-201ENST00000216416 PPIAL4DF5H284 164 aa5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms