RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF626Q68DY1 528 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 GALMQ96C23 342 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 FAHD2AQ96GK7 314 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 CHODLQ9H9P2 273 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1A1Q9P1Q5 309 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC23A1Q9UHI7 598 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 DCHS2Q6V1P9 2916 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFS7O75251 213 aa20.64■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF728P0DKX0 622 aa20.64■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 SSTR5P35346 364 aa20.64■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS2R31P59538 309 aa20.64■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 FXYD4P59646 89 aa20.64■□□□□ 0.9
CAPNS1-215ENST00000628018 C4orf46Q504U0 113 aa20.64■□□□□ 0.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 OR52B4Q8NGK2 314 aa20.64■□□□□ 0.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 TOMM40LQ969M1 308 aa20.64■□□□□ 0.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 CGB7P0DN87 165 aa20.63■□□□□ 0.89
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CAPNS1-215ENST00000628018 IL2RGP31785 369 aa20.63■□□□□ 0.89
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CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM155Q4W5P6 130 aa20.61■□□□□ 0.89
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CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa20.6■□□□□ 0.89
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CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV1-13P0DP09 117 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-215ENST00000628018 C17orf58Q2M2W7 97 aa20.6■□□□□ 0.89
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CAPNS1-215ENST00000628018 CALYQ9NYX4 217 aa20.6■□□□□ 0.89
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CAPNS1-215ENST00000628018 CD300CQ08708 224 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF841Q6ZN19 808 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-215ENST00000628018 SECTM1Q8WVN6 248 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00574Q9H8X3 128 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2S2Q9NQN1 319 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-215ENST00000628018 C19orf12Q9NSK7 152 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-215ENST00000628018 CLN8Q9UBY8 286 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNKO75909 580 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 SULT1A3P0DMM9 295 aa20.58■□□□□ 0.88
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