RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 Q6ZS52 159 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 BEND4Q6ZU67 534 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF525Q8N782 197 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF709Q8N972 641 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 OR1P1Q8NH06 330 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 NEK7Q8TDX7 302 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB1CQ92928 201 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 LURAP1Q96LR2 239 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PSENENQ9NZ42 101 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PRSS50Q9UI38 385 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A0J9YW62 118 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 EPOPA6NHQ4 379 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 IFITM10A6NMD0 228 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF737O75373 536 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CST7O76096 145 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 FABP4P15090 132 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TUBG1P23258 451 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 OMGP23515 440 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PAX9P55771 341 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CCL20P78556 96 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF154Q13106 437 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 IGFBP7Q16270 282 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC25A45Q8N413 288 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 RLN3Q8WXF3 142 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 FRZBQ92765 325 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 LHX4Q969G2 390 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 C14orf144Q96I85 54 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 OR51I2Q9H344 312 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 GP6Q9HCN6 339 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 RPRMQ9NS64 109 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 SEC16AO15027 2179 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 ZFP92A6NM28 416 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 J3QT63 122 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PHOX2AO14813 284 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TMPRSS2O15393 492 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 SOD3P08294 240 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 COX6A1P12074 109 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 B4GALT1P15291 398 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 KLK2P20151 261 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 IL2RGP31785 369 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 LTBRP36941 435 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 FOLR3P41439 243 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 GALR1P47211 349 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 CEBPGP53567 150 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PLGLB1Q02325 96 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC10A1Q14973 349 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TGIF1Q15583 401 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-202ENST00000586851 SUMF1Q8NBK3 374 aa6.6□□□□□ -1.35
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