RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-204ENST00000538708 CD40P25942 277 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-204ENST00000538708 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-204ENST00000538708 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 LTBP1Q14766 1721 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 PPP1R2P9O14990 202 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 THY1P04216 161 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 CALYQ9NYX4 217 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 A0A0G2JMZ2 1700 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.17□□□□□ -1.1
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