RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486192.1

SORCS1-208, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene SORCS1, Length 632 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-208ENST00000486192 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 AUNIPQ9H7T9 357 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 ING3Q9NXR8 418 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 TMEM235A6NFC5 223 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 C15orf65H3BRN8 121 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 F2RL2O00254 374 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 SULT1C2O00338 296 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 FCGR3AP08637 254 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 ELK1P19419 428 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 CD34P28906 385 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 SSTR5P35346 364 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 TAS2R20P59543 309 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 HMGN3Q15651 99 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 MIDNQ504T8 468 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 ARL11Q969Q4 196 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 CREB3L1Q96BA8 519 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 KIRREL1Q96J84 757 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 TBX15Q96SF7 602 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 TAF9BQ9HBM6 251 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 Q9N2K0 584 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 JPT1Q9UK76 154 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 NUP50Q9UKX7 468 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 TRDCB7Z8K6 153 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 C12orf77C9JDV5 145 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 CTDSP2O14595 271 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 RGS11O94810 467 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 AVPP01185 164 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 IFNA2P01563 188 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 IGHV1-69P01742 117 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 HBZP02008 142 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 LPLP06858 475 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 CTXN2P0C2S0 81 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 SRD5A1P18405 259 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 PRSS3P35030 304 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 HLA-DRB3P79483 266 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 LAX1Q8IWV1 398 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF596Q8TC21 504 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 CCDC107Q8WV48 283 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 GHITMQ9H3K2 345 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.31□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 CTDSPLO15194 276 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 FABP7O15540 132 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 HLA-DQB1P01920 261 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 FAM157CP0CG43 387 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 ZBTB25P24278 435 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 PRRX1P54821 245 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 LOXL3P58215 753 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 ACTBP60709 375 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 ACTG1P63261 375 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 OLFML2AQ68BL7 652 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF626Q68DY1 528 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 CNIH2Q6PI25 160 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 ABHD12Q8N2K0 398 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 OR9G1Q8NH87 305 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 SETD6Q8TBK2 473 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 LHX4Q969G2 390 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.3□□□□□ -1.24
SORCS1-208ENST00000486192 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms