RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293889.10

CCDC78-201, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC78, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-201ENST00000293889 NDUFS8O00217 210 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 CRYZL1O95825 349 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 TK1P04183 234 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 GUCA2AQ02747 115 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 OR8H3Q8N146 312 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 NARFLQ9H6Q4 476 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 ITPR3Q14573 2671 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 SSX5O60225 188 aa14.77□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 FCN3O75636 299 aa14.77□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 RRASP10301 218 aa14.77□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 CXCL2P19875 107 aa14.77□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 DSCR9P59020 149 aa14.77□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 ARFRP1Q13795 201 aa14.77□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa14.77□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 Q5PR19 223 aa14.77□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.77□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 GINS4Q9BRT9 223 aa14.77□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
CCDC78-201ENST00000293889 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 VWC2LB2RUY7 222 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 CD74P04233 296 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 LPLP06858 475 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 TAS2R19P59542 299 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 ARPC4P59998 168 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 TOR2AQ5JU69 321 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 SHEQ5VZ18 495 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 FGFRL1Q8N441 504 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 PPP1R35Q8TAP8 253 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 MIOXQ9UGB7 285 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 OPN4Q9UHM6 478 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 DVL1O14640 695 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 CA11O75493 328 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 B3GALNT1O75752 331 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 CSN2P05814 226 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 WNT2P09544 360 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 RPS2P15880 293 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 AESQ08117 197 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 WFDC11Q8NEX6 87 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 COQ2Q96H96 371 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 PCDHB10Q9UN67 800 aa14.76□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 MEIS3P1A6NDR6 274 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 L7N2F9 121 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 MGST3O14880 152 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 NDUFB3O43676 98 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 KCNJ3P48549 501 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 RAB14P61106 215 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF497Q6ZNH5 498 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 OR5D13Q8NGL4 314 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 CCDC107Q8WV48 283 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 NUP50Q9UKX7 468 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 NAPSAO96009 420 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 EDDM3AQ14507 147 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 LRRC10Q5BKY1 277 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 KRBOX4Q5JUW0 171 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 SLC35E4Q6ICL7 350 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 Q6ZPA2 131 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 IDO2Q6ZQW0 420 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 TPRX1Q8N7U7 411 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 OR8B2Q96RD0 313 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF735P0CB33 412 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 NDUFB7P17568 137 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 GLIPR1P48060 266 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 PAX5Q02548 391 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 BAMBIQ13145 260 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 AANATQ16613 207 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 COMMD7Q86VX2 200 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 GAPTQ8N292 157 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 OR4D10Q8NGI6 311 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 CLDND2Q8NHS1 167 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 CHIAQ9BZP6 476 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CCDC78-201ENST00000293889 SLC2A8Q9NY64 477 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.2 ms