RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 TSC22D1Q15714 1073 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 GUK1Q16774 197 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 HFEQ30201 348 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 MIDNQ504T8 468 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 SDK2Q58EX2 2172 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 Q6P435 159 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 PCSK4Q6UW60 755 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 Q6ZT83 130 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 SARAFQ96BY9 339 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 WFDC1Q9HC57 220 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 OBP2BQ9NPH6 170 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 MLXQ9UH92 298 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 PRELID1Q9Y255 219 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 MED12Q93074 2177 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 K7N7A8 449 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 HSPB6O14558 160 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 SSSCA1O60232 199 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 PGA5P0DJD9 388 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 CEACAM1P13688 526 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 CBR1P16152 277 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 ARHGDIBP52566 201 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 ERVK11-1P61568 191 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 ZNF146Q15072 292 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 ZNF497Q6ZNH5 498 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 C17orf78Q8N4C9 275 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 PRSS33Q8NF86 280 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 OR8U1Q8NH10 309 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 RDH5Q92781 318 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 HIPK2Q9H2X6 1198 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 TAAR3PQ9P1P4 343 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 IL36RNQ9UBH0 155 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 RNF150Q9ULK6 438 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 FAM96BQ9Y3D0 163 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 ZNF318Q5VUA4 2279 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 IGSF23A1L1A6 192 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 CDRT15L2A8MXV6 281 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 FAM157AC9JC47 383 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 HS3ST1O14792 307 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 NXPH2O95156 264 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 OR2H2O95918 312 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 IFNA5P01569 189 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 IGHV1-2P23083 117 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 LMO1P25800 156 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 NPBWR1P48145 328 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 TAS2R30P59541 319 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 NHLH2Q02577 135 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 TLE4Q04727 773 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 RHEBQ15382 184 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 GUSBP1Q15486 140 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 AVPI1Q5T686 147 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 PIP4P1Q86T03 277 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 BATF2Q8N1L9 274 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 SCCPDHQ8NBX0 429 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 OR10Z1Q8NGY1 313 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 WNT2BQ93097 391 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 ATP5SQ99766 215 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 BCL2L14Q9BZR8 327 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 TUBA4BQ9H853 241 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 KCNJ16Q9NPI9 418 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 WIPI2Q9Y4P8 454 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 R4GN57 208 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms