RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 BVESQ8NE79 360 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 METTL26Q96S19 204 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 SPSB2Q99619 263 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 OR4X1Q8NH49 305 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 MS4A10Q96PG2 267 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.22□□□□□ -1.09
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PTPRB-204ENST00000538708 CELA3AP09093 270 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 ROM1Q03395 351 aa8.21□□□□□ -1.09
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PTPRB-204ENST00000538708 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
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PTPRB-204ENST00000538708 A0A1W2PS18 150 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 TSTD3H0UI37 97 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 NQO2P16083 231 aa8.21□□□□□ -1.09
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PTPRB-204ENST00000538708 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
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PTPRB-204ENST00000538708 C9orf170A2RU37 121 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 OR2H2O95918 312 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 IGLV3-19P01714 112 aa8.21□□□□□ -1.1
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PTPRB-204ENST00000538708 C11orf42Q8N5U0 333 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.21□□□□□ -1.1
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PTPRB-204ENST00000538708 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 C16orf92Q96LL3 132 aa8.21□□□□□ -1.1
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PTPRB-204ENST00000538708 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 WNT9BO14905 357 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF137PP52743 207 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-204ENST00000538708 BTN1A1Q13410 526 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 ABHD12Q8N2K0 398 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRB-204ENST00000538708 NPAS1Q99742 590 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 PLAC1Q9HBJ0 212 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 CA11O75493 328 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 ASAH2BP0C7U1 165 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 GNLYP22749 145 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 MC5RP33032 325 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 PPP1R1AQ13522 171 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 CLEC12BQ2HXU8 276 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 J3QR06 171 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 BCL2L11O43521 198 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 SCO1O75880 301 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 ZPLD1Q8TCW7 415 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 RAX2Q96IS3 184 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 ELOVL1Q9BW60 279 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 FFAR1O14842 300 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 UBE2L6O14933 153 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-204ENST00000538708 HBZP02008 142 aa8.2□□□□□ -1.1
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