RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 ATP6V0CP27449 155 aa5.95□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 ETV6P41212 452 aa5.95□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 KRTAP10-2P60368 255 aa5.95□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 RHOGP84095 191 aa5.95□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 PRDX4Q13162 271 aa5.95□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 C1DQ13901 141 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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PDCD4-211ENST00000498367 PAGE3Q5JUK9 113 aa5.95□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 FAM120AOSQ5T036 256 aa5.95□□□□□ -1.46
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PDCD4-211ENST00000498367 FBXL14Q8N1E6 418 aa5.95□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM86AQ8N2M4 240 aa5.95□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa5.95□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 FAM151AQ8WW52 585 aa5.95□□□□□ -1.46
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PDCD4-211ENST00000498367 TMEM101Q96IK0 257 aa5.95□□□□□ -1.46
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PDCD4-211ENST00000498367 LRRC61Q9BV99 259 aa5.95□□□□□ -1.46
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PDCD4-211ENST00000498367 OR51E2Q9H255 320 aa5.95□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM9BQ9NQ34 198 aa5.95□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 SLC23A2Q9UGH3 650 aa5.95□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 TNFSF18Q9UNG2 199 aa5.95□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.95□□□□□ -1.46
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PDCD4-211ENST00000498367 MYH15Q9Y2K3 1946 aa5.94□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.94□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 C5orf49A4QMS7 147 aa5.94□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 RIIAD1A6NNX1 92 aa5.94□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 RFXAPO00287 272 aa5.94□□□□□ -1.46
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PDCD4-211ENST00000498367 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.463e-6■■■□□ 16.9
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PDCD4-211ENST00000498367 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
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PDCD4-211ENST00000498367 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.94□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 MED28Q9H204 178 aa5.94□□□□□ -1.46
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PDCD4-211ENST00000498367 SPNP16150 400 aa5.93□□□□□ -1.46
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PDCD4-211ENST00000498367 BRS3P32247 399 aa5.93□□□□□ -1.46
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PDCD4-211ENST00000498367 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
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PDCD4-211ENST00000498367 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa5.93□□□□□ -1.46
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PDCD4-211ENST00000498367 OR8D2Q9GZM6 311 aa5.93□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 OR52D1Q9H346 318 aa5.93□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 RNF122Q9H9V4 155 aa5.93□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 CXorf21Q9HAI6 301 aa5.93□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 MARCH5Q9NX47 278 aa5.93□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 VDAC3Q9Y277 283 aa5.93□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa5.92□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 USP6P35125 1406 aa5.92□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 A0A0B4J2A0 478 aa5.92□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1B0GWB2 263 aa5.92□□□□□ -1.46
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