RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 TDGF1P3P51864 188 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 UCP2P55851 309 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 GNB2P62879 340 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 OR51H1Q8NH63 302 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 KCNK17Q96T54 332 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 WNT16Q9UBV4 365 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.02□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CEACAM18A8MTB9 384 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 TK1P04183 234 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 IRF2P14316 349 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SPINK2P20155 84 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 HNF1AP20823 631 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PLA2G5P39877 138 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 BEND2Q8NDZ0 799 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF407Q9C0G0 2248 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF320A2RRD8 509 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ZFAND5O76080 213 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 HLA-BQ31612 363 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 BSXQ3C1V8 233 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PIGYQ3MUY2 71 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 DIRC2Q96SL1 478 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 VSIRQ9H7M9 311 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 LHFPL6Q9Y693 200 aa14.01□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 IL18BPO95998 194 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 METTL15P1P0C7V9 234 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 BCL2P10415 239 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CCL4P13236 92 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CLDN17P56750 224 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 RAET1LQ5VY80 246 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 OR4F5Q8NH21 305 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 OR4F4Q96R69 305 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SPIN2AQ99865 258 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 NUP210LQ5VU65 1888 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PROB1E7EW31 1015 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ECI1P42126 302 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 UCP3P55916 312 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM241Q24JQ0 296 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ST8SIA1Q92185 356 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ADGRG7Q96K78 797 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 FRYQ5TBA9 3013 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 B4DEV8 164 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ZNHIT1O43257 154 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SELEP16581 610 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF100Q8IYN0 542 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 RASL10BQ96S79 203 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 RBKSQ9H477 322 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 HPRT1P00492 218 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf42Q8N5U0 333 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 OR5L2Q8NGL0 311 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 POC1BQ8TC44 478 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 RHBDD1Q8TEB9 315 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 OR51I2Q9H344 312 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SRD5A3Q9H8P0 318 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 NAGKQ9UJ70 344 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CEP192Q8TEP8 1941 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 GRIFINA4D1Z8 144 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 IGHG1P01857 330 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PMP22Q01453 160 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 OR8G2PQ6IF36 304 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 DNASE2BQ8WZ79 361 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 B3GAT1Q9P2W7 334 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 TNFSF10P50591 281 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PLPPR5Q32ZL2 321 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 FAM78BQ5VT40 261 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 VN1R17PQ8TDU5 208 aa13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 COTL1Q14019 142 aa13.98□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 FAM90A2PQ658T7 463 aa13.98□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 RABEPKQ7Z6M1 372 aa13.98□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM256Q8N2U0 113 aa13.98□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SAMD10Q9BYL1 202 aa13.98□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SDF2L1Q9HCN8 221 aa13.98□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC3CA6NJW4 275 aa13.98□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 E9PLN8 166 aa13.98□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 K7ESF4 209 aa13.98□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PITX3O75364 302 aa13.98□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF737O75373 536 aa13.98□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 IFNA1P01562 189 aa13.98□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 EGR1P18146 543 aa13.98□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 DPPA3Q6W0C5 159 aa13.98□□□□□ -0.17
CCSAP-204ENST00000483092 BORCS8Q96FH0 119 aa13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms