RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPDHP28-201ENST00000455134 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPDHP28-201ENST00000455134 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GAPDHP28-201ENST00000455134 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPDHP28-201ENST00000455134 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GAPDHP28-201ENST00000455134 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPDHP28-201ENST00000455134 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SNTNA6NMZ2 147 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 MPZL2O60487 215 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLIC3O95833 236 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM106CPP0CH98 169 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM11P17152 192 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SERPINA2P20848 420 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 REG1BP48304 166 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF137PP52743 207 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 CFHR3Q02985 330 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 HNF4GQ14541 408 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLHL22Q53GT1 634 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 DDI2Q5TDH0 399 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SATL1Q86VE3 508 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 GAPTQ8N292 157 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 STPG2Q8N412 459 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR148Q8TDV2 347 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 DUX3Q96PT4 197 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPER1Q99527 375 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM192AQ9GZU8 254 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 S100A14Q9HCY8 104 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SERPINE3A8MV23 424 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 H0YHG0 523 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 H3BUI4 141 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPX5O75715 221 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 MT-ND4P03905 459 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF134P52741 427 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 HES1Q14469 280 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 RSU1Q15404 277 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 MPV17LQ2QL34 196 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC58Q4VC31 144 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNF152Q8N8N0 203 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR52N1Q8NH53 320 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMIM19Q96E16 107 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAX2Q96IS3 184 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q96MT0 163 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABCG5Q9H222 651 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 C12orf77C9JDV5 145 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCRL2O00421 344 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 ORC5O43913 435 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD2P06729 351 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 FSTP19883 344 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCKP27707 260 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 BDKRB2P30411 391 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYCNOSP40205 109 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR12P47775 334 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEFB136Q30KP8 78 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms