RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 FCGR3AP08637 254 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF212Q495C1 297 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 C1orf185Q5T7R7 199 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 COX6A1P12074 109 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM37Q8WXS4 190 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 SPTBP11277 2137 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PP11 408 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 GALR1P47211 349 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 SPSB2Q99619 263 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 P2RY6Q15077 328 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF441Q8N8Z8 693 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 Q9N2K0 584 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 SP9P0CG40 484 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 UCP2P55851 309 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 RTP5Q14D33 572 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 LYPD8Q6UX82 237 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 ASCL5Q7RTU5 278 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 ICE1Q9Y2F5 2266 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 GOSR1O95249 250 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM24BQ8N5W8 94 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 LPAR5Q9H1C0 372 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 ISG15P05161 165 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 BMI1P35226 326 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 PCOLCEQ15113 449 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 TGIF1Q15583 401 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM122AQ96E09 287 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1B0GU03 582 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 CDRT15L2A8MXV6 281 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 G6PCP35575 357 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 SULT1A1P50225 295 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 C1orf174Q8IYL3 243 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 PRDM6Q9NQX0 595 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV3-11P04433 115 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 LIPGQ9Y5X9 500 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 LHFPL6Q9Y693 200 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 CCL21O00585 134 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 PSG2P11465 335 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 BRS3P32247 399 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 LYZP61626 148 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC24A4Q8NFF2 622 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 MS4A3Q96HJ5 214 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 PIPOXQ9P0Z9 390 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 WIPI2Q9Y4P8 454 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 UCNP55089 124 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 VAX1Q5SQQ9 334 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM219AQ8IW50 185 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF519Q8TB69 540 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 PRDX2P32119 198 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM50BP56557 158 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTDAPP60985 99 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 LURAP1Q96LR2 239 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 PRNDQ9UKY0 176 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 NPTNQ9Y639 398 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 PRR33A8MZF0 331 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 AHRRA9YTQ3 701 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 FGF12P61328 243 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 SPNS3Q6ZMD2 512 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 HARBI1Q96MB7 349 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 C12orf57Q99622 126 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 NAT8BQ9UHF3 227 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 TIAF1O95411 115 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 COL10A1Q03692 680 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 OR52L2PQ8NGH6 319 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 PRSS50Q9UI38 385 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 SYNGR1O43759 233 aa18.58■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 SPINK4O60575 86 aa18.58■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 C1orf100Q5SVJ3 147 aa18.58■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF2Q99496 336 aa18.58■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 UBTD1Q9HAC8 227 aa18.58■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 INSIG2Q9Y5U4 225 aa18.58■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 SMIM17P0DL12 118 aa18.58■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 TPPP2P59282 170 aa18.58■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 MOGAT2Q3SYC2 334 aa18.58■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF260Q3ZCT1 412 aa18.58■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNHIT1O43257 154 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRJ-201ENST00000418331 LMX1BO60663 402 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTCAP3Q53RY4 240 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRJ-201ENST00000418331 CDCP2Q5VXM1 449 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRJ-201ENST00000418331 GYPAP02724 150 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRJ-201ENST00000418331 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
PTPRJ-201ENST00000418331 VSIG10L2P0DP72 767 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRJ-201ENST00000418331 CCL8P80075 99 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRJ-201ENST00000418331 SSX8Q7RTT4 187 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM167BQ9NRX6 74 aa18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 171.7 ms