RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 A0A1W2PRD5 423 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 A0A1W2PRF3 423 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 A0A1W2PRM7 423 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 FUOMA2VDF0 154 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 MFNGO00587 321 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 IFNA2P01563 188 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 MT-ND4P03905 459 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 TNFSF8P32971 234 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 MADCAM1Q13477 382 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 C11orf91Q3C1V1 193 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 ZNF260Q3ZCT1 412 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 TMEM69Q5SWH9 247 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 SLC35E4Q6ICL7 350 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 CNIH2Q6PI25 160 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 ZNF497Q6ZNH5 498 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 TCF23Q7RTU1 214 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 PNKDQ8N490 385 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 DIRAS2Q96HU8 199 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 EXTL2Q9UBQ6 330 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 AK3Q9UIJ7 227 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 KIF25Q9UIL4 384 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 ADAM30Q9UKF2 790 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 MXRA5Q9NR99 2828 aa10.28□□□□□ -0.76
CNMD-201ENST00000377962 MEIKINA0A087WXM9 373 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 TRAV39A0A0B4J263 110 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 ODAMA1E959 279 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 CA11O75493 328 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 CLPXO76031 633 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 S100A5P33763 92 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 TALDO1P37837 337 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 TAS2R20P59543 309 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 PAX5Q02548 391 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 ARFRP1Q13795 201 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 ARL6IP1Q15041 203 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 C11orf42Q8N5U0 333 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 OR4K15Q8NH41 348 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 CCDC107Q8WV48 283 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 AUNIPQ9H7T9 357 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 KPTNQ9Y664 436 aa10.27□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 hADV38S2A0JD32 116 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 TMEM235A6NFC5 223 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 SERPINE3A8MV23 424 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 VENTXO95231 258 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 HLA-DQB1P01920 261 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 CD3GP09693 182 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 PTHLHP12272 177 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 MNDAP41218 407 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 HACD4Q5VWC8 232 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 GAPTQ8N292 157 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 TEX29Q8N6K0 151 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 KIR3DL3Q8N743 410 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 TNFRSF14Q92956 283 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 MDFIQ99750 246 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa10.26□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 NAPSAO96009 420 aa10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 IGHV1-69P01742 117 aa10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 MELTFP08582 738 aa10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 DLX6P56179 175 aa10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 GPR157Q5UAW9 335 aa10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 HCP5Q6MZN7 132 aa10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 ZNF565Q8N9K5 539 aa10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 OR13A1Q8NGR1 328 aa10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 DUX5Q96PT3 197 aa10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 ESM1Q9NQ30 184 aa10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 PTTG2Q9NZH5 202 aa10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 OR6C3Q9NZP0 311 aa10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 JMJD1CQ15652 2540 aa10.25□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa10.24□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 FABP12A6NFH5 140 aa10.24□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 M0R1W7 72 aa10.24□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 TCF21O43680 179 aa10.24□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 FPR2P25090 351 aa10.24□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 GNG2P59768 71 aa10.24□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 PITPNAQ00169 270 aa10.24□□□□□ -0.77
CNMD-201ENST00000377962 DEFB112Q30KQ8 113 aa10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms