RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368215.7

PTPRK-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-206ENST00000368215 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 FCGR3BO75015 233 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 MT-CO2P00403 227 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 HLA-DRB3P79483 266 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 AESQ08117 197 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 C4orf17Q53FE4 359 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 OR4F5Q8NH21 305 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 OR4F4Q96R69 305 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 GAB2Q9UQC2 676 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 DEDDO75618 318 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 HAND1O96004 215 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 MOB1BQ7L9L4 216 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 WDFY1Q8IWB7 410 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 MALSU1Q96EH3 234 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 SSX3Q99909 188 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 SEMA5BQ9P283 1151 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF708P17019 499 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 FGF7P21781 194 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 HIST2H3AQ71DI3 136 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 BIVMQ86UB2 503 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 HSF4Q9ULV5 492 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 LDLRAD4O15165 306 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 SYNGR2O43760 224 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 ACP1P24666 158 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 ATP6V0CP27449 155 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 UBE2G2P60604 165 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 NAAAQ02083 359 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 AWAT1Q58HT5 328 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 POC1AQ8NBT0 407 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 RAB40CQ96S21 281 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 S1PR3Q99500 378 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 POMT1Q9Y6A1 747 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 C9orf172C9J069 976 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 CDS2O95674 445 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 HNF1AP20823 631 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 FHITP49789 147 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 S100A12P80511 92 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 MOB3AQ96BX8 217 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 OR5H1A6NKK0 313 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 FGF2P09038 288 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 NAT2P11245 290 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 GNG10P50151 68 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF273Q14593 569 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF429Q86V71 674 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 CYB5BO43169 146 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM230Q96A57 120 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 AQP10Q96PS8 301 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 NIT2Q9NQR4 276 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-206ENST00000368215 H0YIZ8 118 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 MKRN2OSH3BPM6 223 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 NQO2P16083 231 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 MDH2P40926 338 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 NPBWR1P48145 328 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 KCNJ3P48549 501 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 FOXO1Q12778 655 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 IGFBP7Q16270 282 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 TP53RKQ96S44 253 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 TM2D1Q9BX74 207 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 SLC25A22Q9H936 323 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 A0A1W2PPH5 198 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 LRRC3CA6NJW4 275 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 LRRC30A6NM36 301 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF716A6NP11 495 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 F2RP25116 425 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-206ENST00000368215 C12orf57Q99622 126 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms