RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 ISG15P05161 165 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR8G5Q8NG78 346 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 FGF14Q92915 247 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 IGHEP01854 428 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 SELEP16581 610 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 DHRS3O75911 302 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 MSX1P28360 303 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 THBS3P49746 956 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR1K1Q8NGR3 316 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 A0A0G2JNG1 304 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 KIR2DS5Q14953 304 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 SLC37A2Q8TED4 501 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 MOB3AQ96BX8 217 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 TMEM106BQ9NUM4 274 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR6C3Q9NZP0 311 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 FREM3P0C091 2139 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 UBALD1Q8TB05 177 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 TNFSF4P23510 183 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 ZNF611Q8N823 705 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 CADM4Q8NFZ8 388 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 EGR1P18146 543 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 MYBPHQ13203 477 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 RABEPKQ7Z6M1 372 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 CUTCQ9NTM9 273 aa14.48□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 SHBQ15464 509 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 MENTQ9BUN1 341 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 ALKBH4Q9NXW9 302 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 PDCD6O75340 191 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 MPLP40238 635 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 CATR1Q13166 79 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 HGFACQ04756 655 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 RTN4RL2Q86UN3 420 aa14.47□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 CBLN1P23435 193 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 SERF2P84101 59 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 C8orf44Q96CB5 159 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 IFITM10A6NMD0 228 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 M0R2Z0 102 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 NDUFB4O95168 129 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 NTSR1P30989 418 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 PLP2Q04941 152 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 RPEL1Q2QD12 228 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 FHL5Q5TD97 284 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR5B3Q8NH48 314 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 FAM122AQ96E09 287 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 KLHDC7BQ96G42 594 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 IMMP2LQ96T52 175 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 H0YIG0 161 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 SLC35B1P78383 322 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 KIAA1644Q3SXP7 199 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR5D13Q8NGL4 314 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.46□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 TSC2P49815 1807 aa14.46□□□□□ -0.1
PACS1-201ENST00000320580 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
PACS1-201ENST00000320580 TNFSF13O75888 250 aa14.45□□□□□ -0.1
PACS1-201ENST00000320580 GBGT1Q8N5D6 347 aa14.45□□□□□ -0.1
PACS1-201ENST00000320580 ASB10Q8WXI3 467 aa14.45□□□□□ -0.1
PACS1-201ENST00000320580 SPSB1Q96BD6 273 aa14.45□□□□□ -0.1
PACS1-201ENST00000320580 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa14.45□□□□□ -0.1
PACS1-201ENST00000320580 J3QR89 54 aa14.45□□□□□ -0.1
PACS1-201ENST00000320580 CA11O75493 328 aa14.45□□□□□ -0.1
PACS1-201ENST00000320580 FOXF1Q12946 379 aa14.45□□□□□ -0.1
PACS1-201ENST00000320580 PLPPR5Q32ZL2 321 aa14.45□□□□□ -0.1
PACS1-201ENST00000320580 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.45□□□□□ -0.1
PACS1-201ENST00000320580 D2HGDHQ8N465 521 aa14.45□□□□□ -0.1
PACS1-201ENST00000320580 NOXO1Q8NFA2 376 aa14.45□□□□□ -0.1
PACS1-201ENST00000320580 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.45□□□□□ -0.1
PACS1-201ENST00000320580 FRG2CA6NGY1 282 aa14.45□□□□□ -0.1
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