RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587547.1

NEDD4L-218, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-218ENST00000587547 CHRM2P08172 466 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 AMY2BP19961 511 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 HNF1AP20823 631 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 CPT2P23786 658 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 PITPNBP48739 271 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 ACTG1P63261 375 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 IL13RA1P78552 427 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 MADCAM1Q13477 382 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF146Q15072 292 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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NEDD4L-218ENST00000587547 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 Q6P435 159 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 LINC00596Q86U02 117 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 FGFRL1Q8N441 504 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 CHST4Q8NCG5 386 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 Q8NFD4 153 aa6.99□□□□□ -1.29
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NEDD4L-218ENST00000587547 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 OR8B2Q96RD0 313 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 MRI1Q9BV20 369 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 CHST6Q9GZX3 395 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 PPA2Q9H2U2 334 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 ING3Q9NXR8 418 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 CTSZQ9UBR2 303 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 MIOXQ9UGB7 285 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF222Q9UK12 451 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 SPATA2Q9UM82 520 aa6.99□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 UBE2QL1A1L167 161 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 CTDSP2O14595 271 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 NDUFB3O43676 98 aa6.98□□□□□ -1.29
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NEDD4L-218ENST00000587547 NDUFB7P17568 137 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 ELK1P19419 428 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 IL2RGP31785 369 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 GZMKP49863 264 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 SCAND1P57086 179 aa6.98□□□□□ -1.29
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NEDD4L-218ENST00000587547 EDDM3AQ14507 147 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 MPV17LQ2QL34 196 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 CR1LQ2VPA4 569 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 RAB12Q6IQ22 244 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF561Q8N587 486 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 SUN5Q8TC36 379 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 ST8SIA4Q92187 359 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 PTX4Q96A99 478 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 PHF21AQ96BD5 680 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 RAB39BQ96DA2 213 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 SDSLQ96GA7 329 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 MED30Q96HR3 178 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 CYYR1Q96J86 154 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 TM2D1Q9BX74 207 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.97□□□□□ -1.29
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NEDD4L-218ENST00000587547 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 DVL1O14640 695 aa6.97□□□□□ -1.29
NEDD4L-218ENST00000587547 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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