RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 BIVMQ86UB2 503 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF561Q8N587 486 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CD177Q8N6Q3 437 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SDSLQ96GA7 329 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 MED30Q96HR3 178 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 OR8B2Q96RD0 313 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CCL13Q99616 98 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 NOTCH2Q04721 2471 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM235A6NFC5 223 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FABP12A6NFH5 140 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 XRCC3O43542 346 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 NDUFB3O43676 98 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF737O75373 536 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 GLAP06280 429 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CD3GP09693 182 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SELLP14151 372 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SLC25A16P16260 332 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 GNB3P16520 340 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 OR3A1P47881 315 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 KCNJ3P48549 501 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ARFRP1Q13795 201 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 EDDM3AQ14507 147 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 GRK1Q15835 563 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 Q6ZTK2 550 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CCDC190Q86UF4 302 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 OR8H2Q8N162 312 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ST8SIA4Q92187 359 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 DYRK2Q92630 601 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 RAB39BQ96DA2 213 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 TSC22D3Q99576 134 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 PECRQ9BY49 303 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CHST6Q9GZX3 395 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM165Q9HC07 324 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ETAA1Q9NY74 926 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 MIOXQ9UGB7 285 aa6.36□□□□□ -1.39
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GARNL3-218ENST00000487565 V9GYH0 126 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 A0A0G2JMP0 313 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 A0A0X1KG70 313 aa6.35□□□□□ -1.39
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GARNL3-218ENST00000487565 UBE2QL1A1L167 161 aa6.35□□□□□ -1.39
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GARNL3-218ENST00000487565 CA11O75493 328 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 TPPPO94811 219 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CSN2P05814 226 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 HEXAP06865 529 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 NDUFB7P17568 137 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ETV6P41212 452 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 P2RX3P56373 397 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 EDDM3BP56851 147 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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