RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 MTCP1P56278 107 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 RAB1AP62820 205 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 AKR1C1Q04828 323 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 UBE2V2Q15819 145 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 SNAI3Q3KNW1 292 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 C9orf135Q5VTT2 229 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZRG5 221 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 LGI3Q8N145 548 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 WDR31Q8NA23 367 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 NAXEQ8NCW5 288 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 OR8G5Q8NG78 346 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 SPIN2AQ99865 258 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF286AQ9HBT8 521 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.23□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF850A8MQ14 1090 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 PRSS44E7EML9 344 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 SIGLEC5O15389 551 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 MT-ND4LP03901 98 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 SMIM6P0DI80 62 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM225BP0DP42 221 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 GLI4P10075 376 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 GABRR1P24046 479 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 RBP2P50120 134 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 PIGPP57054 158 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM33P57088 247 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 HERV-K104P61576 105 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 CTAG1AP78358 180 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 TGFBR3Q03167 851 aa8.22□□□□□ -1.09
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POLR1A-208ENST00000486964 RHEBQ15382 184 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM42Q69YG0 159 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.22□□□□□ -1.09
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POLR1A-208ENST00000486964 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 RTN4RL2Q86UN3 420 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 OR5D18Q8NGL1 313 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 BORCS8Q96FH0 119 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 GINS3Q9BRX5 216 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 EGLN1Q9GZT9 426 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 IFT22Q9H7X7 185 aa8.22□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
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POLR1A-208ENST00000486964 STARD10Q9Y365 291 aa8.22□□□□□ -1.09
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POLR1A-208ENST00000486964 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 FAM90A10PA6NDY2 464 aa8.21□□□□□ -1.09
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POLR1A-208ENST00000486964 FAM90A18PA6NE21 464 aa8.21□□□□□ -1.09
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POLR1A-208ENST00000486964 FAM90A22PA8MWA6 464 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 FAM90A12PA8MX19 464 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa8.21□□□□□ -1.09
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POLR1A-208ENST00000486964 FAM90A15PP0C7V4 464 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 FAM90A13PP0C7W8 464 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 FAM90A14PP0C7W9 464 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 FAM90A24PP0C7X0 464 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 DANCRP0C864 163 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 EDN3P14138 238 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 PTAFRP25105 342 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 CHATP28329 748 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 CD80P33681 288 aa8.21□□□□□ -1.09
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POLR1A-208ENST00000486964 UCP2P55851 309 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF266Q14584 549 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM187Q14656 261 aa8.21□□□□□ -1.09
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POLR1A-208ENST00000486964 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 C6orf201Q7Z4U5 140 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 MDP1Q86V88 176 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 PRR7Q8TB68 274 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 NPRL2Q8WTW4 380 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 PIGTQ969N2 578 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 REEP6Q96HR9 211 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 C12orf57Q99622 126 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 AMDHD2Q9Y303 409 aa8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
POLR1A-208ENST00000486964 BSNQ9UPA5 3926 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 UMAD1C9J7I0 102 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 ST8SIA3O43173 380 aa8.2□□□□□ -1.1
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