RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 LINC00346Q8IVM7 164 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM219AQ8IW50 185 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF100Q8IYN0 542 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 C1orf87Q8N0U7 546 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF283Q8N7M2 679 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 CLEC18CQ8NCF0 446 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR5R1Q8NH85 324 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 M1APQ8TC57 530 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC22A8Q8TCC7 542 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 PATE1Q8WXA2 126 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 MAFIPQ8WZ33 124 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 TSLPQ969D9 159 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 IL22RA2Q969J5 263 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPTSSAQ969W0 71 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 MOB3AQ96BX8 217 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF524Q96C55 264 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 MUCL1Q96DR8 90 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 BTF3L4Q96K17 158 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM56Q96MV1 263 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 OXGR1Q96P68 337 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 PFDN5Q99471 154 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 P2RX4Q99571 388 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 LRRC61Q9BV99 259 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 GGACTQ9BVM4 153 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 SCNM1Q9BWG6 230 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 TM2D2Q9BX73 214 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 RTN4RQ9BZR6 473 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 VN1R1Q9GZP7 353 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM234AQ9H0X4 552 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 METTL9Q9H1A3 318 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF286AQ9HBT8 521 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 B3GAT1Q9P2W7 334 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 MMP17Q9ULZ9 603 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-55P-201ENST00000411092 ATG2BQ96BY7 2078 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 PCNTO95613 3336 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 A0A1W2PR64 198 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 A0A1W2PRV1 198 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 RBFOX3A6NFN3 312 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 GJE1A6NN92 205 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 LMO7DNF2Z398 122 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 H3BQ15 152 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 TP53I11O14683 189 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 RRHO14718 337 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 AGPAT2O15120 278 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 TXNL1O43396 289 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 DUX1O43812 170 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 NME2P1O60361 137 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 TOMM40O96008 361 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 OPN1MWP04001 364 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 CTXN2P0C2S0 81 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 OPN1MW2P0DN77 364 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 OPN1MW3P0DN78 364 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC25A6P12236 298 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 MYF5P13349 255 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 HLA-DOBP13765 273 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 FOLR1P15328 257 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 NQO2P16083 231 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF17P17021 662 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 SERPINA2P20848 420 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 UCP1P25874 307 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 CEACAM6P40199 344 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 HAAOP46952 286 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 GLIPR1P48060 266 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 RND2P52198 227 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR2B8PP59922 312 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 UBE2KP61086 200 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 HERV-K104P61576 105 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 H3F3AP84243 136 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 ACY1Q03154 408 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 FOXF1Q12946 379 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 IL24Q13007 206 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 MYBPHQ13203 477 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 HNF4GQ14541 408 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-55P-201ENST00000411092 RAB35Q15286 201 aa3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104 ms