RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380298.2

SLC22A23-201, Transcript of solute carrier family 22 member 23, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC22A23, Length 1,574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A23-201ENST00000380298 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 MT-ND4P03905 459 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF565Q8N9K5 539 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 KPTNQ9Y664 436 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 DSCAML1Q8TD84 2053 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF273Q14593 569 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 C7orf69Q9H7B7 122 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 YAE1D1Q9NRH1 226 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 SERPINE3A8MV23 424 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 A8MV72 311 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 M0R1W7 72 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 MFNGO00587 321 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 ONECUT1Q9UBC0 465 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 HPGDSO60760 199 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 ARF6P62330 175 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 TCF23Q7RTU1 214 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 DYRK2Q92630 601 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF714Q96N38 554 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 TAS2R3Q9NYW6 316 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 AK3Q9UIJ7 227 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 KCNK7Q9Y2U2 307 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 AUP1Q9Y679 476 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 A0A1W2PPE2 198 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 A0A1W2PR64 198 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 A0A1W2PRV1 198 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 POM121CA8CG34 1229 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 XRCC3O43542 346 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF728P0DKX0 622 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 GNB3P16520 340 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 CDK2P24941 298 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 CR1LQ2VPA4 569 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 CDNFQ49AH0 187 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 METTL11BQ5VVY1 283 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 RTN4RL2Q86UN3 420 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 MCFD2Q8NI22 146 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 A3GALT2U3KPV4 340 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa22.64■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 CYYR1Q96J86 154 aa22.64■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 WDFY2Q96P53 400 aa22.64■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 TMEM160Q9NX00 188 aa22.64■■□□□ 1.22
SLC22A23-201ENST00000380298 HIVEP2P31629 2446 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 RGS5O15539 181 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 NAPSAO96009 420 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 RBP4P02753 201 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 ELK1P19419 428 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 GZMHP20718 246 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 OR13A1Q8NGR1 328 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 SIRPDQ9H106 197 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 ADAM30Q9UKF2 790 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 TRAV18A0A075B6X5 111 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 C17orf98A8MV24 154 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 CTDSP2O14595 271 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 CD3GP09693 182 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 CCL3L1P16619 93 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 DLX6P56179 175 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF260Q3ZCT1 412 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 MMP27Q9H306 513 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 C12orf4Q9NQ89 552 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 OPN4Q9UHM6 478 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 TOX4O94842 621 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 CGB3P0DN86 165 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 CGB7P0DN87 165 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 MMP9P14780 707 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 GLP1RP43220 463 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 TMEM69Q5SWH9 247 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 HACD4Q5VWC8 232 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 OLFML2AQ68BL7 652 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 TRAT1Q6PIZ9 186 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 C11orf42Q8N5U0 333 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 TEX29Q8N6K0 151 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 OR4K15Q8NH41 348 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 CCDC107Q8WV48 283 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SLC22A23-201ENST00000380298 FAM25AB3EWG3 89 aa22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms