RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637888.1

AC107871.1-201, humanhuman

TSL 5

Gene AC107871.1, Length 2,941 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC107871.1-201ENST00000637888 THNSL2Q86YJ6 484 aa14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 BATF2Q8N1L9 274 aa14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 FAM210BQ96KR6 192 aa14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 OR10A2Q9H208 303 aa14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 DEDDO75618 318 aa14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 CBR3O75828 277 aa14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 AMBPP02760 352 aa14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 CHRM2P08172 466 aa14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 AMY2BP19961 511 aa14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 FUT3P21217 361 aa14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 RND3P61587 244 aa14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 RAC1P63000 192 aa14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 SLC10A1Q14973 349 aa14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 DTD1Q8TEA8 209 aa14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 TMEM54Q969K7 222 aa14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
AC107871.1-201ENST00000637888 CER1O95813 267 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 P04436 131 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 CCL1P22362 96 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 DTWD2Q8NBA8 298 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 OR5H2Q8NGV7 314 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 DEPPQ9NTK1 212 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 EHFQ9NZC4 300 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 DHRS3O75911 302 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 OR3A2P47893 321 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 BRICD5Q6PL45 260 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 MEMO1Q9Y316 297 aa14.64□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 SNU13P55769 128 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 UCP2P55851 309 aa14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 CARD18P57730 90 aa14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 C10orf128Q5T292 105 aa14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 OR5R1Q8NH85 324 aa14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 TCFL5Q9UL49 500 aa14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 PADI1Q9ULC6 663 aa14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 PINLYPA6NC86 204 aa14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 RBFOX3A6NFN3 312 aa14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 MMP9P14780 707 aa14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 SPINK14Q6IE38 97 aa14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 C20orf196Q8IYI0 205 aa14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa14.63□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 FAM221AA4D161 298 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 HPNP05981 417 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 TMEM225BP0DP42 221 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 GPR137CQ8N3F9 429 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 DEFB123Q8N688 67 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 FGFBP3Q8TAT2 258 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 ABHD3Q8WU67 409 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 RAB24Q969Q5 203 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 GPR87Q9BY21 358 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 VAMP5O95183 116 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 LCATP04180 440 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 FPR2P25090 351 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 GNG10P50151 68 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 SRYQ05066 204 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 PDCD1Q15116 288 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 NCR3LG1Q68D85 454 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 COMMD1Q8N668 190 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 SSC4DQ8WTU2 575 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 FBLN5Q9UBX5 448 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 LOXL2Q9Y4K0 774 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 DOCK7Q96N67 2140 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 SEC11BP0C7V7 166 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 OMGP23515 440 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 MTCP1P56278 107 aa14.62□□□□□ -0.07
AC107871.1-201ENST00000637888 HIKESHIQ53FT3 197 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms