RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637881.1

CDKL5-211, Transcript of cyclin dependent kinase like 5, humanhuman

TSL 5

Gene CDKL5, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5-211ENST00000637881 S100A7AQ86SG5 101 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 LRTM2Q8N967 370 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 Q8N976 141 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 OR6N2Q8NGY6 317 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 OR4K13Q8NH42 304 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 CALHM2Q9HA72 323 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 PELI2Q9HAT8 420 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 EHFQ9NZC4 300 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 MMP17Q9ULZ9 603 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 DHDHQ9UQ10 334 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.86□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 A0A1W2PQF6 199 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 TMEM250H0YL14 139 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 ST8SIA3O43173 380 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 NPIPB7O75200 414 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 NID1P14543 1247 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 DUSP1P28562 367 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 CD1BP29016 333 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 CCKBRP32239 447 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 PTGER4P35408 488 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 CXCL12P48061 93 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 THBS3P49746 956 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 TLE3Q04726 772 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 BAXQ07812 192 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 Q0VG73 95 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 ADIRFQ15847 76 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 PMCHL1Q16048 86 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 LYPD6Q86Y78 171 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 DEFB119Q8N690 84 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 OR6K6Q8NGW6 343 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 RLN3Q8WXF3 142 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 PSMF1Q92530 271 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 PARLQ9H300 379 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 WDR76Q9H967 626 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 PIEZO1Q92508 2521 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 A0A1W2PP55 124 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 WIPF3A6NGB9 483 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 IFNL4K9M1U5 179 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 HS3ST1O14792 307 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 TAX1BP3O14907 124 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 LAMTOR5O43504 91 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 MT-CO2P00403 227 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 CD55P08174 381 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 MMP9P14780 707 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 GLB1P16278 677 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 CDKN1AP38936 164 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 PPP1CBP62140 327 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 SLAQ13239 276 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 NFATC4Q14934 902 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 CST6Q15828 149 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 HIST3H3Q16695 136 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 SYT13Q7L8C5 426 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 DEFB125Q8N687 156 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 OR5A2Q8NGI9 324 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 ZNF480Q8WV37 535 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 CLDN23Q96B33 292 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.85□□□□□ -1.31
CDKL5-211ENST00000637881 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms