RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515711.1

LMNA-224, Transcript of lamin A/C, human

TSL 5

Gene LMNA, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMNA-224	ENST00000515711	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	ERGIC1	Q969X5	290 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711		Q9N2K0	584 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	GPR132	Q9UNW8	380 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	DPRX	A6NFQ7	191 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	IFNL4	K9M1U5	179 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	OR2H2	O95918	312 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	HAND1	O96004	215 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	ADH4	P08319	380 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	PGAM2	P15259	253 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	GLRA1	P23415	457 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF81	P51508	661 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	RAP2B	P61225	183 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	PDCD1	Q15116	288 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	MSMP	Q1L6U9	139 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	DYRK2	Q92630	601 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	HYLS1	Q96M11	299 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	DECR2	Q9NUI1	292 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	IL19	Q9UHD0	177 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	FBN3	Q75N90	2809 aa		10.1	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	NF1	P21359	2839 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	TRDC	B7Z8K6	153 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	SNAPC5	O75971	98 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	DIRAS3	O95661	229 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	ZBTB25	P24278	435 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	LMO1	P25800	156 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	DUSP1	P28562	367 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	CD34	P28906	385 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	NPY4R	P50391	375 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	UCP3	P55916	312 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	HERV-K104	P61576	105 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	DHODH	Q02127	395 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	DHRS2	Q13268	280 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	BRICD5	Q6PL45	260 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	LRP11	Q86VZ4	500 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	LRRC29	Q8WV35	223 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	RDH5	Q92781	318 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	OR2V2	Q96R30	315 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	PHB2	Q99623	299 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	CENPE	Q02224	2701 aa		10.09	□□□□□ -0.79
LMNA-224	ENST00000515711	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711		A0A0B4J2A0	478 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	C9orf170	A2RU37	121 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	SRRM5	B3KS81	715 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	SIRPB1	O00241	398 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	HSPB6	O14558	160 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	HS3ST1	O14792	307 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	FABP7	O15540	132 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	RGS11	O94810	467 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	TK1	P04183	234 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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