RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 HLA-HP01893 362 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ESR1P03372 595 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 MAS1P04201 325 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 SFTA3P0C7M3 94 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 GLRXP35754 106 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 SOX3P41225 446 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 INPP1P49441 399 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 WNT3P56703 355 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 RPL8P62917 257 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC35A2P78381 396 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.782e-7■■■□□ 16.6
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RABGGTB-213ENST00000496055 TBPL2Q6SJ96 375 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 BAALCQ8WXS3 180 aa3.95□□□□□ -1.78
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RABGGTB-213ENST00000496055 DIRAS2Q96HU8 199 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 BTF3L4Q96K17 158 aa3.95□□□□□ -1.78
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RABGGTB-213ENST00000496055 ASB6Q9NWX5 421 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 LAMP3Q9UQV4 416 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 WSB1Q9Y6I7 421 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 V9GYY9 64 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PR80 420 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 PSMB11A5LHX3 300 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 CGB1A6NKQ9 187 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM233B4DJY2 109 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OR1F1O43749 312 aa3.95□□□□□ -1.78
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZG16O60844 167 aa3.95□□□□□ -1.78
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RABGGTB-213ENST00000496055 SLC25A12O75746 678 aa3.95□□□□□ -1.78
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RABGGTB-213ENST00000496055 AWAT1Q58HT5 328 aa3.95□□□□□ -1.78
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RABGGTB-213ENST00000496055 C1QL3Q5VWW1 255 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 C17orf64Q86WR6 236 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 CHST4Q8NCG5 386 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 NPEPL1Q8NDH3 523 aa3.95□□□□□ -1.78
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RABGGTB-213ENST00000496055 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 CA10Q9NS85 328 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM96BQ9Y3D0 163 aa3.95□□□□□ -1.78
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RABGGTB-213ENST00000496055 NAV2Q8IVL1 2488 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 DHRS12A0PJE2 317 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 FTCDNL1E5RQL4 147 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 K7EM74 188 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 MPZL2O60487 215 aa3.95□□□□□ -1.78
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RABGGTB-213ENST00000496055 MPGP29372 298 aa3.95□□□□□ -1.78
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF549Q6P9A3 640 aa3.95□□□□□ -1.78
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF595Q8IYB9 648 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa3.95□□□□□ -1.78
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RABGGTB-213ENST00000496055 OR51G2Q8NGK0 314 aa3.95□□□□□ -1.78
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 Q8WTZ3 238 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 HIST1H2ACQ93077 130 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 APH1AQ96BI3 265 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
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