RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 DANCRP0C864 163 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SLC35E2P0CK97 266 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 IGFBP2P18065 325 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PI3P19957 117 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ALOX5APP20292 161 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 DMRTC1Q5HYR2 192 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 BCORP1Q8N888 145 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 FBLIM1Q8WUP2 373 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SLC38A5Q8WUX1 472 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.625e-7■■□□□ 12.4
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM204Q9BSN7 226 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OR10A2Q9H208 303 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 MS4A6AQ9H2W1 248 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 HS3ST2Q9Y278 367 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 DCCP43146 1447 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 FIGNL2A6NMB9 653 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 RER1O15258 196 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PVRP15151 417 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 EVI2AP22794 236 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 FUT6P51993 359 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 MYBPHQ13203 477 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ETDBQ3ZM63 59 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZVH6 145 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OR10G9Q8NGN4 311 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 GPR82Q96P67 336 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00597Q9H2U6 94 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM242Q9NWH2 141 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 UNC13BO14795 1591 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 A2ML1A8K2U0 1454 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 F8W1H4 67 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SSSCA1O60232 199 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 C1QL1O75973 258 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OR2H2O95918 312 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 HLA-DQA1P01909 254 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A6P12236 298 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEA5P43359 124 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 MTCP1P56278 107 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SPNS2Q8IVW8 549 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SLC16A11Q8NCK7 471 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OR4X2Q8NGF9 303 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OR5P2Q8WZ92 322 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 FAM234AQ9H0X4 552 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A51Q9H1U9 297 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TMPRSS2O15393 492 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 DHHO43323 396 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 HERVK_113P61574 105 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TAF10Q12962 218 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SLC10A6Q3KNW5 377 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 C10orf91Q5T1B1 145 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PGBD5Q8N414 524 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SCCPDHQ8NBX0 429 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 KCNS1Q96KK3 526 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 BPIFA1Q9NP55 256 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CLEC1BQ9P126 229 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 C5AR2Q9P296 337 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 A8MWV9 139 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CST7O76096 145 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 NGFRP08138 427 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OR9G9P0C7N8 305 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ELNP15502 786 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 IGFBP4P22692 258 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SRD5A2P31213 254 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TNFSF9P41273 254 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 INSL4Q14641 139 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A52Q3SY17 297 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A42Q86VD7 318 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM25Q86YD3 366 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF114Q8NC26 417 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OR9G4Q8NGQ1 327 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OR5C1Q8NGR4 320 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 HIST1H4GQ99525 98 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A33Q9BSK2 321 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ERG28Q9UKR5 140 aa4.92□□□□□ -1.62
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