RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 OR2A5Q96R48 311 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 TBX15Q96SF7 602 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 FOXJ3Q9UPW0 622 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 LANCL1O43813 399 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 HPXP02790 462 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 DLX1P56177 255 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 BTG1P62324 171 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 KRTCAP3Q53RY4 240 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 BAP18Q8IXM2 172 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 HARBI1Q96MB7 349 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 C9orf170A2RU37 121 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 COL8A1P27658 744 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 DDOSTP39656 456 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 RAB32Q13637 225 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 LHX8Q68G74 356 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ZNF502Q8TBZ5 544 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 HSF4Q9ULV5 492 aa9.33□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 STRCQ7RTU9 1775 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 FFAR1O14842 300 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SMIM18P0DKX4 95 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 CLDN20P56880 219 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 Q6ZN92 141 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 LINC01555Q8NAE3 123 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SLC25A40Q8TBP6 338 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 GUCD1Q96NT3 240 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 CDRT15L2A8MXV6 281 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 BCL2L11O43521 198 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 CCKARP32238 428 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 PP6455Q8WZ26 134 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 GABARAPL3Q9BY60 117 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 KIR2DS2P43631 304 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 PRSS8Q16651 343 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 DOLPP1Q86YN1 238 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 LRRC75AQ8NAA5 344 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ZNF488Q96MN9 340 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 RASL12Q9NYN1 266 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 LILRA5A6NI73 299 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ADAM11O75078 769 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 CD82P27701 267 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 COL10A1Q03692 680 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 MMDQ15546 238 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 TM4SF20Q53R12 229 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 PTOV1Q86YD1 416 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 NTNG2Q96CW9 530 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 STARD4Q96DR4 205 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 IGLV3-27P01718 113 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 CCL3P10147 92 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 REG1AP05451 166 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 NUBP1P53384 320 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SKP2Q13309 424 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 Q8WTZ3 238 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.32□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ABCA3Q99758 1704 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 OOEPA6NGQ2 149 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 P01737 135 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 AANATQ16613 207 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ST3GAL2Q16842 350 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 C1QL3Q5VWW1 255 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 CLN8Q9UBY8 286 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 CES1P1Q9UKY3 287 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 CELA2AP08217 269 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SLC25A53Q5H9E4 307 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 RSG1Q9BU20 258 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 IGHV3-23P01764 117 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 NMUP48645 174 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ADIPOQQ15848 244 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ASB10Q8WXI3 467 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 MRGPRFQ96AM1 343 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 AKAP6Q13023 2319 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SOCS1O15524 211 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 GABRA1P14867 456 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SNX22Q96L94 193 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 TBX21Q9UL17 535 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 SLC45A2Q9UMX9 530 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 PRSS44E7EML9 344 aa9.31□□□□□ -0.92
CLN8-201ENST00000331222 CTLA4P16410 223 aa9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms