RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321556.4

PINK1-201, Transcript of PTEN induced putative kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PINK1, Length 2,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1-201ENST00000321556 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa20.3■□□□□ 0.84
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PINK1-201ENST00000321556 A0A1W2PPE2 198 aa20.29■□□□□ 0.84
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PINK1-201ENST00000321556 TMEM222Q9H0R3 208 aa20.29■□□□□ 0.84
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PINK1-201ENST00000321556 ZNF565Q8N9K5 539 aa20.27■□□□□ 0.84
PINK1-201ENST00000321556 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa20.27■□□□□ 0.84
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PINK1-201ENST00000321556 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
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PINK1-201ENST00000321556 TRAV39A0A0B4J263 110 aa20.27■□□□□ 0.83
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PINK1-201ENST00000321556 UCP3P55916 312 aa20.27■□□□□ 0.83
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PINK1-201ENST00000321556 C17orf78Q8N4C9 275 aa20.26■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 C15orf54Q8N8G6 183 aa20.26■□□□□ 0.83
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PINK1-201ENST00000321556 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 SLC22A20A6NK97 555 aa20.26■□□□□ 0.83
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PINK1-201ENST00000321556 H3BP45 60 aa20.26■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 OR5C1Q8NGR4 320 aa20.26■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 UBALD1Q8TB05 177 aa20.26■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 C1orf196B1AJZ1 125 aa20.25■□□□□ 0.83
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PINK1-201ENST00000321556 Q9N2K0 584 aa20.25■□□□□ 0.83
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PINK1-201ENST00000321556 LINC01387J3KSC0 135 aa20.25■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 TK1P04183 234 aa20.25■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 ZXDAP98168 799 aa20.25■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 ODF3L1Q8IXM7 274 aa20.25■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 KCNJ16Q9NPI9 418 aa20.25■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa20.24■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 K7N7A8 449 aa20.24■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 DYNLT3P51808 116 aa20.24■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 HAGHQ16775 308 aa20.24■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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PINK1-201ENST00000321556 RNF122Q9H9V4 155 aa20.24■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 ZNF391Q9UJN7 358 aa20.24■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 DCAF12Q5T6F0 453 aa20.24■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 TMEM252Q8N6L7 170 aa20.24■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 SULT1A1P50225 295 aa20.23■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 ZNF154Q13106 437 aa20.23■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PINK1-201ENST00000321556 NANPQ8TBE9 248 aa20.23■□□□□ 0.83
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