RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 CHST6Q9GZX3 395 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 VSTM5A8MXK1 200 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 NDUFS8O00217 210 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 LILRA1O75019 489 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 PMP2P02689 132 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 GPM6AP51674 278 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 OR51B6Q9H340 312 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 DYNLRB1Q9NP97 96 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 VSIG4Q9Y279 399 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 SPEF1Q9Y4P9 236 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 UBE2QL1A1L167 161 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 OR5B21A6NL26 309 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF732B4DXR9 585 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 SMLR1H3BR10 107 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 IFNA6P05013 189 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 TAS2R46P59540 309 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 PIGYQ3MUY2 71 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 OR2T2Q6IF00 324 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 HYLS1Q96M11 299 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ST3GAL6Q9Y274 331 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAM90A10PA6NDY2 464 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAM90A18PA6NE21 464 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAM90A16PA6NEW6 464 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAM90A7PA6NKC0 464 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 OR2AT4A6NND4 320 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 CEACAM18A8MTB9 384 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAM90A22PA8MWA6 464 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAM90A12PA8MX19 464 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAM90A15PP0C7V4 464 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAM90A13PP0C7W8 464 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAM90A14PP0C7W9 464 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAM90A24PP0C7X0 464 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 RAC2P15153 192 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 AMY2BP19961 511 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 PMELP40967 661 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 HAAOP46952 286 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 NPBWR2P48146 333 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 SNU13P55769 128 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 UCP2P55851 309 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 IFITM2Q01629 132 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 CDK10Q15131 360 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 BHLHE23Q8NDY6 225 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF581Q9P0T4 197 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 MGAT4CQ9UBM8 478 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 LRP5LA4QPB2 252 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 M0R233 179 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 PDCD6O75340 191 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 OR4E1P0C645 316 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 DTYMKP23919 212 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 IL2RGP31785 369 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 GNG3P63215 75 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 MKXQ8IYA7 352 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 OR5H2Q8NGV7 314 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 DUSP13Q9UII6 198 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 H3BUI4 141 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 OR2A4O95047 310 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 BCL3P20749 454 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 FGF12P61328 243 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 C4orf46Q504U0 113 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF573Q86YE8 665 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 OR5AP2Q8NGF4 316 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 TERB2Q8NHR7 220 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 SLC25A40Q8TBP6 338 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 OR2A7Q96R45 310 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 AK3Q9UIJ7 227 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC6-201ENST00000243108 IQCF6A8MYZ5 107 aa14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms