RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562298.1

VPS9D1-AS1-201, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VPS9D1-AS1, Length 931 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF521Q96K83 1311 aa21.16■□□□□ 0.98
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ALDH1L1O75891 902 aa21.16■□□□□ 0.98
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRKG1Q13976 671 aa21.16■□□□□ 0.98
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DLGAP5Q15398 846 aa21.16■□□□□ 0.98
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.16■□□□□ 0.98
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KAZALD1Q96I82 304 aa21.16■□□□□ 0.98
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FZD1Q9UP38 647 aa21.16■□□□□ 0.98
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 JAG2Q9Y219 1238 aa21.16■□□□□ 0.98
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.15■□□□□ 0.98
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 F8W031 263 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PLIN1O60240 522 aa21.15■□□□□ 0.98
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.15■□□□□ 0.98
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.15■□□□□ 0.98
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.15■□□□□ 0.98
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.15■□□□□ 0.98
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 AOX1Q06278 1338 aa21.14■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TM4SF4P48230 202 aa21.14■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.14■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SUCLG2Q96I99 432 aa21.14■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TBC1D8O95759 1140 aa21.13■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CFAP100Q494V2 611 aa21.13■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.13■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.12■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SPDYE6P0CI01 402 aa21.12■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 UTYO14607 1347 aa21.11■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CLRN2A0PK11 232 aa21.11■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.11■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HTTP42858 3142 aa21.11■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.1■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GYG1P46976 350 aa21.1■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 UBE4AQ14139 1066 aa21.1■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MAP3K11Q16584 847 aa21.1■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SPRYD7Q5W111 196 aa21.1■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.1■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MYO1BO43795 1136 aa21.09■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SREBF2Q12772 1141 aa21.09■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.09■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LAMB1P07942 1786 aa21.09■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SOX10P56693 466 aa21.08■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 VEZTQ9HBM0 779 aa21.08■□□□□ 0.97
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GPR25O00155 361 aa21.07■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.07■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.07■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.07■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.07■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.07■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.06■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RASA3Q14644 834 aa21.05■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LRRC24Q50LG9 513 aa21.05■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 WNK4Q96J92 1243 aa21.05■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.05■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.05■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PTPRCP08575 1304 aa21.04■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CENPFP49454 3210 aa21.04■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.04■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.04■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.04■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OTOFQ9HC10 1997 aa21.04■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GRIK5Q16478 980 aa21.03■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.03■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.03■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 UNCXA6NJT0 531 aa21.02■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.02■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IFNL1Q8IU54 200 aa21.02■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.02■□□□□ 0.96
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 E9PSI1 815 aa21.01■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.01■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GJA5P36382 358 aa21.01■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CRKP46108 304 aa21.01■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 METTL24Q5JXM2 366 aa21.01■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.01■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms