RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	GGA3	Q9NZ52	723 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	JAG2	Q9Y219	1238 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	EYA2	O00167	538 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	GYG1	P46976	350 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	METTL24	Q5JXM2	366 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	CERS5	Q8N5B7	392 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	PDE8B	O95263	885 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	OGFOD1	Q8N543	542 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		15.33	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	WNT10B	O00744	389 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	SRGAP3	O43295	1099 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	SULF1	Q8IWU6	871 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	PANK1	Q8TE04	598 aa		15.32	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	SASH1	O94885	1247 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	MMP14	P50281	582 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	GRM1	Q13255	1194 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	CAPNS2	Q96L46	248 aa		15.31	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549		F8W031	263 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	ATP8B2	P98198	1209 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	CDCA5	Q96FF9	252 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	SIL1	Q9H173	461 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		15.3	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	FGFR2	P21802	821 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	POLA2	Q14181	598 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	SSH3	Q8TE77	659 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	15.29	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	15.29	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		15.29	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	AOC2	O75106	756 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	ECE1	P42892	770 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	BCAM	P50895	628 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	HUNK	P57058	714 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	COG6	Q9Y2V7	657 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	ZBTB22	O15209	634 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	FOXN1	O15353	648 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	DLGAP5	Q15398	846 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	GRIK5	Q16478	980 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	VPS37D	Q86XT2	251 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	LPIN2	Q92539	896 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	WBP1L	Q9NX94	342 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RBM23-231	ENST00000557549	AOX1	Q06278	1338 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	SLC5A1	P13866	664 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	CFAP100	Q494V2	611 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	CEP85	Q6P2H3	762 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	15.25	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	MOB2	Q70IA6	237 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	ZIC5	Q96T25	663 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	ATP2B3	Q16720	1220 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	RGMB	Q6NW40	437 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	CLRN2	A0PK11	232 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		15.23	■□□□□ 0.03

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